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논문 기본 정보

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저널정보
한국콘텐츠학회 한국콘텐츠학회논문지 한국콘텐츠학회논문지 제8권 제1호
발행연도
2008.1
수록면
259 - 271 (13page)

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본 논문에서는 단백질-단백질 상호작용과 도메인 분석을 통해 기능이 알려지지 않은 미지 단백질의 기능을 예측할 수 있는 알고리즘을 제안한다. 먼저 MIPS 데이터베이스로 부터 효모에 대한 단백질-단백질 상호작용(PPI) 네트워크를 구축한다. 구축된 PPI 네트워크는(단백질 3,637개, 상호작용 10,391개) 많은 상호작용을 갖는 소수의 단백질들을 갖으면서 단백질 클러스터의 고유한 모듈성을 보이는 스케일 프리 네트워크와 계층적 네트워크의 특성을 보인다. 단백질-단백질 상호작용 데이터베이스는 Y2H(Yeast Two Hybrid) 실험 등으로 얻어졌기 때문에 부정확한 데이터를 포함하고 있다. 따라서 본 논문에서는 세포상의 localization을 고려하여 부정확한 데이터를 정제하여 PPI 네트워크를 재구축한다. 그리고 허브 단백질과 네트워크 구조를 분석하여 네트워크로부터 구조적 모듈을 발견하고 이를 정의한다. 또한 이러한 구조적 모듈로 부터 단백질의 도메인을 분석하여 기능적 모듈을 밝히고, 높은 확실성을 가지는 기능적 모듈을 기반으로 미지 단백질에 대한 기능을 예측한다.
#단백질-단백질 상호작용 #단백질 기능발견 #단백질 도메인 #바이오인포매틱스 #Protein-Protein Interaction #Functional Prediction #Protein Domain #Bioinformatics

목차

요약
Abstract
Ⅰ. 서론
Ⅱ. 관련연구
Ⅲ. 제안하는 단백질 기능발견 방법
Ⅳ. 성능평가
Ⅴ. 결론
참고문헌
저자소개

참고문헌 (14)

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1. [학술지(정기간행물)] - E. Ravasz / 2003 / Hierarchical organization in complex networks / Phys. Rev E67 (026122) google schola 2. [학위논문] - 강희영 / 2005 / 내피세포의 생존과 죽음 경로 및 효모의 단백질 네트워크 분석 / 석사 / 충북대학교 google schola 3. [단행본] - G. Cynthia / 2001 / Developing Bioinformatics Computer Skills / O'reilly press google schola 4. [학술지(정기간행물)] - J. Jeffery / 2000 / Structural genomics and its importance for gene function analysis / Nature Biotechnology 18 (18) : 282 ~ 287 google schola 5. [학술대회논문] - I. Takashi / 2001 / A comprehensive two-hybrid analysis to explore the yeast protein interactome / Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America google schola

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