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자료유형
학술저널
저자정보
권재 (고려대학교) 박민구 (고려대학교) 이승은 (한국과학기술연구원) 이창준 (한국과학기술연구원)
저널정보
한국뇌신경과학회 Experimental Neurobiology Experimental Neurobiology Vol.27 No.1
발행연도
2018.1
수록면
65 - 75 (11page)

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Circadian rhythm is defined as a 24-hour biological oscillation, which persists even without any external cues but also can be reentrained by various environmental cues. One of the widely accepted circadian rhythm behavioral experiment is measuring the wheel-running activity (WRA) of rodents. However, the price for commercially available WRA recording system is not easily affordable for researchers due to high-cost implementation of sensors for wheel rotation. Here, we developed a cost-effective and comprehensive system for circadian rhythm recording by measuring the house-keeping activities (HKA). We have monitored animal’s HKA as electrical signal by simply connecting animal housing cage with a standard analog/digital converter: input to the metal lid and ground to the metal grid floor. We show that acquired electrical signals are combined activities of eating, drinking and natural locomotor behaviors which are well-known indicators of circadian rhythm. Post-processing of measured electrical signals enabled us to draw actogram, which verifies HKA to be reliable circadian rhythm indicator. To provide easy access of HKA recording system for researchers, we have developed user-friendly MATLAB-based software, Circa Analysis. This software provides functions for easy extraction of scalable “touch activity” from raw data files by automating seven steps of post-processing and drawing actograms with highly intuitive user-interface and various options. With our cost-effective HKA circadian rhythm recording system, we have estimated the cost of our system to be less than $150 per channel. We anticipate our system will benefit many researchers who would like to study circadian rhythm.

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참고문헌 (28)

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Ko CH / 2006 / Molecular components of the mammalian circadian clock / Hum Mol Genet 15:R271~R277 google schola Partch CL / 2014 / Molecular architecture of the mammalian circadian clock / Trends Cell Biol 24:90~99 google schola Takahashi JS / 2017 / Transcriptional architecture of the mammalian circadian clock / Nat Rev Genet 18:164~179 google schola Panda S / 2016 / Circadian physiology of metabolism / Science 354:1008~1015 google schola Bass J / 2016 / Circadian time signatures of fitness and disease / Science 354:994~999 google schola

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