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논문 기본 정보

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학술저널
저자정보
Kim Kyoung-Dong (Chung-Ang University) Lieberman Paul M. (The Wistar Institute)
저널정보
대한생화학·분자생물학회 Experimental and Molecular Medicine Experimental and Molecular Medicine Vol.56
발행연도
2024.4
수록면
799 - 808 (10page)
DOI
10.1038/s12276-024-01207-0

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The dynamic spatial organization of genomes across time, referred to as the four-dimensional nucleome (4DN), is a key component of gene regulation and biological fate. Viral infections can lead to a reconfiguration of viral and host genomes, impacting gene expression, replication, latency, and oncogenic transformation. This review provides a summary of recent research employing three-dimensional genomic methods such as Hi–C, 4C, ChIA-PET, and HiChIP in virology. We review how viruses induce changes in gene loop formation between regulatory elements, modify chromatin accessibility, and trigger shifts between A and B compartments in the host genome. We highlight the central role of cellular chromatin organizing factors, such as CTCF and cohesin, that reshape the 3D structure of both viral and cellular genomes. We consider how viral episomes, viral proteins, and viral integration sites can alter the host epigenome and how host cell type and conditions determine viral epigenomes. This review consolidates current knowledge of the diverse host-viral interactions that impact the 4DN.

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