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초록·키워드
Geometric properties are critical for the function of molecules consisting of atoms with different radii which are usually modeled as spheres in 3D. “Molecular Geometry” is a theoretical framework of computational understanding of the geometry of molecules in the claim that most molecular structure problems can be effectively and efficiently facilitated by the “geometrization” of the problem into that among spheres in 3D whose solution can be easily found via “geometry kernel”. In this paper, we report BULL!, the molecular geometry engine based on the Voronoi diagram of spheres, the quasi-triangulation, and the beta-complex. Being a program implemented in C++, application programmers can simply call API-functions of BULL! to create application programs correctly, efficiently, and conveniently. The BULL! is designed compatibly so that application programs are completely independent of future modifications and improvements. The BULL! engine will be freely available from the Voronoi Diagram Research Center at Hanyang University.
본문·목차
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