[우수논문] 두 문자열의 극대공통부분서열을 찾는 새로운 알고리즘

Q: 이 논문에서 정의한 극대공통부분서열이란 무엇인가?

두 문자열에서 공통적으로 나타나는 부분적인 문자열 서열 중, 어떤 문자를 추가로 삽입하더라도 더 이상 공통부분서열이 될 수 없는 가장 긴 형태의 서열을 의미한다.

Q: 제시된 새로운 MCS 알고리즘이 기존 알고리즘보다 효과적인 이유는 무엇인가?

연구 결과, 상수 k를 이용하여 O(k)개의 공통 문자를 확인하고 적절한 문자를 선택함으로써 기존 Sakai 및 Lee, Na 알고리즘보다 더 긴 극대공통부분서열을 찾을 수 있으며, 특히 알파벳 크기가 클수록 그 성능 차이가 더욱 뚜렷하게 나타난다.

신현준; 심정섭

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저자정보: 신현준 (인하대학교) 심정섭 (인하대학교)

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두 문자열의 공통부분서열(Common Subsequence)에 어떤 문자를 삽입해도 공통부분서열을 만들 수 없다면 그 공통부분서열은 극대공통부분서열(Maximal Common Subsequence, MCS)이다. 길이가 가장 긴 MCS는 최장공통부분서열(Longest Common Subsequence, LCS)이다. 두 문자열의 MCS 중 하나를 선형에 가까운 시간에 찾는 알고리즘이 제시되었다. 그러나 그 알고리즘이 ... 전체 초록 보기

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