Ecological Study of Escherichia coli Isolates with Phylogenetic Grouping, Antibiotic Resistance, and Virulence Gene Profiling

Q: 이 논문에서 정의한 계통 유전학적 그룹핑이란 무엇인가?

대장균을 유전적 특성에 따라 분류하는 방법으로, 본 연구에서는 multiplex PCR 분석을 통해 대장균을 A, B1, B2, D의 네 가지 그룹으로 구분하여 분석하는 조작적 정의를 사용한다.

Q: 한국 내 대장균의 숙주별 항생제 내성 및 integrase 유전자 보유 특성은 어떠한가?

연구 결과, 돼지에서 분리된 균주가 평균 38%로 가장 높은 항생제 내성 비율을 보였으며, integrase 유전자 보유율 또한 46.1%로 숙주 중 가장 높게 나타나 항생제 내성 확산 가능성이 가장 큰 것으로 확인되었다.

Tatsuya Unno; Hor-Gil Hur

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자료유형: 학술대회자료

저자정보: Tatsuya Unno (Gwangju Intitute of Science and Technology) Hor-Gil Hur (Gwangju Intitute of Science and Technology)

저널정보: 한국미생물학회 한국미생물학회 학술대회논문집 2009년도 International Meeting of the Microbiological Society of Korea, May

발행연도: 2009.5

수록면: 137 - 138 (2page)

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Total 1729 Escherichia coli isolates were obtained from feces of 138 humans, 376 domesticated animals (chicken, duck, beef cattle, dairy cattle, and swine), and 24 wild geese, including 96 isolates from the Yeongsan River in Jeonam Province, Korea. Genotypically unique strains were indicated using Horizontal fluorophore-enhanced rep-PCR DNA fingerprinting (HFERP) [1]. Multiplex PCR analysis done for phylogenetic grouping [2] indicated that none of the strains belonged to E. coli phylogenetic group B2. In contrast, phylogenetic group B2 strains were detected in about 17% (8 of 48 isolates) from 24 wild geese feces and in 3% (3 of 96) isolates obtained from the Yeongsan River. The distribution of E. coli strain in phylogenetic groups A, B1, and D varied depending on the host examined. Another multiplex PCR analysis was done for virulence gene detection targeting eaeA, hlyA, stx1, stx2, est, elt and ipaH [3, 4]. Subsequently, the distribution of E. coli virotypes of Enteropathogenic E. coli (EPEC), Eenterohemorrhagic E. coli (EHEC), Enteroinvasive E. coli (EIEC) and Enterotoxin producing E. coli (ETEC), were determined. Total 89 unique strains were assigned to the 4 virotypes as follows: EHEC (18 strains), EIEC (41 strains), EPEC (9 strains) and ETEC (14 strains). Virulence genes were most frequently present in the phylog ... 전체 초록 보기

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