Eco-toxicogenomics Research with Fish

Park, Kyeong-Seo; Kim, Han-Na; Gu, Man-Bock

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자료유형: 학술저널

저자정보: Park, Kyeong-Seo (National Research Lab on Environmental Biotechnology Gwangju Institute of Science and Technology [GIST]) Kim, Han-Na (National Research Lab on Environmental Biotechnology Gwangju Institute of Science and Technology [GIST]) Gu, Man-Bock (National Research Lab on Environmental Biotechnology Gwangju Institute of Science and Technology [GIST])

저널정보: 대한독성유전단백체학회 Molecular & cellular toxicology Molecular & cellular toxicology 제1권 제1호

발행연도: 2005.1

수록면: 17 - 25 (9page)

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There are some critical drawbacks in the use of biomarkers for a global assessment of the toxicological impacts many chemicals and environmental pollutants have, primarily due to an individual biomarker's specificity for an explicit chemical or toxicant. In other words, the biomarker-based assessment methodology used to analyze toxicological effects lacks a high-throughput capability. Therefore, eco-toxicogenomics, or the study of toxicogenomics with organisms present within a given environmental locale, has recently been introduced with the advent of the so-called "-omics" era, which began with the creation of microarray technologies. Fish are comparable with humans in their toxicological responses and thus data from toxicogenomic studies performed with fish could be applied, with appropriate tools and implementation protocols, to the evaluation of environments where human or animal health is of concern. At present, there have been very active research streams for developing expression sequence tag (EST) databases (DBs) for zebra fish and rainbow trout. Even though few reports involve toxicogenomic studies with fish, a few groups have successfully fabricated and used cDNA microarrays or oligo DNA chips when studying the toxicological impacts of hypoxia or some toxicants with fish. Furthermore, it is strongly believed that this technology can also be implemented with non-model fish. With the standardization of DNA microarray technologies and ample progress in bioinformatics and proteomic technologies, data obtained from DNA microarray technologies offer not only multiple biomarker assays or an analysis of gene expression profiles, but also a means of elucidating gene networking, gene-gene relations, chemical-gene interactions, and chemical-chemical relationships. Accordingly, the ultimate target of eco-toxicogenomics should be to predict and map the pathways of stress propagation within an organism and to analyze stress networking.

#fish #toxicogenomics

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