Practices in cryo-EM single particle analysis data processing: data transfer between RELION and cryoSPARC

Jinwoo Kim; Jin Young Kang

doi:10.34184/kssb.2024.12.2.29

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자료유형: 학술저널

저자정보: Jinwoo Kim (Department of Chemistry, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon 34141, Republic of Korea) Jin Young Kang (Department of Chemistry, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Daejeon 34141, Republic of Korea)

저널정보: 한국구조생물학회 Biodesign Biodesign Vol.12 No.2

발행연도: 2024.6

수록면: 29 - 38 (10page)

DOI: 10.34184/kssb.2024.12.2.29

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The recent advancement of cryo-EM data analysis software packages substantially improved the results, producing higher-resolution maps and finding hidden structural elements or conformations. Among many cryo-EM data analysis software, RELION and cryoSPARC are the two most used packages because they are easy to use, the GUI is intuitive, and produce good results. In this report, we compared the two packages regarding their functionalities and suggested practical methods to transfer data between the two packages using PyEM script, csparc2star.py. The protocols we suggested here would help cryo-EM users to utilize the different and diverse functions of the two packages in a variety of ways.

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