Genetic Study of the Class Dinophyceae Including Red Tide Microalgae Based on a Partial Sequence of SSU Region: Molecular Position of Korean Isolates of Cochlodinium polykrikoides Margalef and Gyrodinium aureolum Hulburt

Q: 이 논문에서 정의한 SSU 부위 유전자란 무엇인가?

SSU 부위 유전자는 핵에 암호화된 작은 소단위 리보솜 DNA(SSU rDNA)의 염기서열을 의미한다. 이는 와편모조류의 계통학적 관계를 분석하고 종 간의 유전적 차이를 식별하는 데 사용되는 핵심 분자 마커이다. 특히 형태학적 구분이 어려운 종들의 유전적 다양성과 진화적 관계를 밝히는 데 유용하게 활용된다.

Q: 와편모조류의 SSU 유전자 분석 결과, Gyrodinium과 Gymnodinium 속의 계통학적 위치는 어떠한가?

연구 결과, Gyrodinium과 Gymnodinium 속은 형태학적 분류와 달리 SSU 유전자 분석에서 다형 계통도를 형성하는 것으로 나타났다. 특히 한국에서 분리된 Gyrodinium aureolum과 Cochlodinium polykrikoides는 Gyrodinium 속보다는 Gymnodinium 속과 유전적으로 더 가까운 위치에 속하는 것으로 분석되었다. 이는 기존의 형태학적 분류 체계에 대한 재평가가 필요함을 시사한다.

조은섭

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저자정보: 조은섭

저널정보: 한국생명과학회 생명과학회지 생명과학회지 제14권 제4호

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유해성 적조생물 Cochlodinium polykrikoides/Gyrodinium aurelum을 포함한 43 종류의 와편조류를 대상으로 SSU 부위 유전자를 분석했다. 유전자 염기서열에 의거한 상호 계통수는 parisomny, distance, maxium 방법으로 실행했다. Noctiluca scintillans, Gonyaulax spinifera와 Crythecodinium cohnii 종 들은 와편모조류 중 가장 유전적으로 먼 것으로 보였다. Alexandrium과 Symbiodinium 종 간의 bootstrap는 70% 이상의 상호 단일 계통도를 보인 반면에, Gymnodinium과 Gyrodinium은 근립절약계수와 최대 유사도 방법에서 다형 계통도를 나타내었다. Gyroddinium aurelum과 G. dorsum/G. galathenum의 유전적 분화율은 7.4% (45 bp) 였고, G. aurelum과 G. mikimotoi 상호간에는 0.9% (5bp) 밖에 나타나지 않았다. 또한 C. polykrikoides와 G. aurelum도 5.2% (31bp)로 낮은 유전적 분화율을 보였다. 계통도를 분석한 결과 G. aureolum과 C. polykrikoides는 Gyrodinium 보다 Gymnodinim 속에 훨씬 더 근접하게 나타났다.

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