Duplex SDS-PAGE를 이용한 단백질 분리향상

Q: 이 논문에서 정의한 Duplex SDS-PAGE란 무엇인가?

Duplex SDS-PAGE는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 SDS-PAGE를 동일한 분리 원리로 두 번 연속 전개하는 전기영동 방법이다. 1차 전기영동 후 얻은 젤을 잘라 2차 전기영동에 가로 방향으로 로딩하여 진행하며, 기존의 2D-electrophoresis와 달리 IPG strip을 사용하지 않아 비용과 시간을 절감하면서도 단백질 분리능을 향상시키는 경제적인 분석법이다.

Q: Duplex SDS-PAGE가 기존 SDS-PAGE보다 단백질 분리능을 향상시키는 핵심 원리는 무엇인가?

연구 결과, Duplex SDS-PAGE는 1차 전기영동으로 분리되지 않았던 단백질들을 2차 전기영동을 통해 대각선 방향으로 추가 분리함으로써 분리능을 향상시킨다. 이는 2차 전기영동 시 런닝 버퍼, 아크릴아마이드 젤 조성, 전기영동 전개 시간 등 분석 조건을 1차와 다르게 적용할 수 있기 때문이며, 이를 통해 목표 단백질의 특성에 맞는 최적화된 분리가 가능하다.

표재성; 노시훈; 송진수; 이경현; 김희준; 박정일; 권성원

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자료유형: 학술저널

저자정보: 표재성 노시훈 송진수 이경현 김희준 박정일 권성원

저널정보: 한국분석과학회 분석과학 분석과학 제19권 제6호

발행연도: 2006.12

수록면: 529 - 534 (6page)

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SDS-PAGE를 이용한 일반적인 단백질 분리는 단백질을 분자량에 따라 분리하는 방법이며 가장 보편적이고, 간단한 방법 중의 하나이다. 본 연구는 SDS-PAGE (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis)를 두 번에 걸쳐 동일한 분리 원리로 이차원으로 전개하는 방법의 전기영동을 시도하여 기존의 일차원 전기영동 분석법과 비교하였으며, 그 결과 향상된 분리능이 본 연구의 이차원 전기영동법에서 확인되었다. Gel에서 분리된 단백질들은 MALDI TOF MS를 이용하여 동정하여 서로 다른 단백질임이 확인되었으며, 이러한 duplex SDS-PAGE 분리법은 상대적으로 적은 비용으로 단백질 분리능을 용이하게 향상시킬 수 있는 경제적인 분석법으로 이용될 수 있을 것이다.

#protein separation #SDS-PAGE #MALDI TOF MS

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