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대한기계학회 대한기계학회 춘추학술대회 대한기계학회 2007도 추계학술대회 강연 및 논문 초록집
발행연도
2007.10
수록면
75 - 80 (6page)

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In this study, we compared two different fast algorithms for molecular dynamics simulations. One algorithm partitions simulation domain into several cells and assigns molecules to these cells by their positions. Using this cell-molecule relationship, this method is efficient to find the nearby molecules. We propose another algorithm which uses a hierarchical tree data structure. The tree structure is adaptive to the distribution of molecules. And both algorithms can be applied to make 'neighbor list' to reduce the number of unnecessary inter-atomic distance calculations in molecular simulations. However, the effectiveness of the neighbor list algorithm, it is useless when the number of molecules and simulation domain are increased with time. Results show that proposed algorithm is effective due to the adaptiveness to the distribution of molecules.
#Molecular dynamics(분자동역학) #Fast algorithm(고속 알고리즘) #Tree structure(트리구조) #Neighbor list(이웃 리스트)

목차

Abstract
1. 서론
2. 고속화 알고리즘
3. 알고리즘 성능비교
4. 결론
참고문헌

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UCI(KEPA) : I410-ECN-0101-2009-550-016066406