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논문 기본 정보

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저널정보
Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 제36권 제3호
발행연도
2009.6
수록면
135 - 139 (5page)

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여러 문자열들을 비교하여 유사성 또는 거리(오차)를 계산하는 문제는 패턴매칭, 웹검색, 바이오인포매틱스, 컴퓨터 보안 등 다양한 응용 분야와의 연관성으로 인해 활발히 연구되어 왔다. 주어진 문자열 집합 내의 여러 문자열들의 거리를 비교하기 위해 주어진 집합 내의 모든 문자열들을 대표하는 한 문자열(대표문자열)을 찾는 방법이 있다. 대표문자열 방법은 주어진 문자열 집합과 가장 유사한 한 문자열을 찾는 방법으로 주로 이용되는 목적함수는 거리반경과 거리합이 있다. 거리반경은 집합 내의 문자열들과 특정 문자열과의 거리들의 최대값으로 정의되며, 모든 문자열들 중에서 최소의 거리반경을 만드는 문자열을 주어진 문자열 집합에 대한 거리반경기반 대표문자열이라 한다. 거리합은 집합 내의 문자열들과 특정 문자열과의 거리들의 합으로 정의되며, 모든 문자열들 중에서 최소의 거리합을 만드는 문자열을 주어진 문자열 집합에 대한 거리합기반 대표문자열이라 한다. 본 논문에서는 메트릭 거리함수에 대해 거리반경기반 대표 문자열 문제가 NP-완전임을 증명한다.
#대표문자열 #거리반경 #NP-완전 #consensus string #radius #NP-completeness

목차

요약
Abstract
1. 서론
2. 관련 연구
3. 거리반경기반 대표문자열 문제의 NP-완전
4. 결론
참고문헌

참고문헌 (19)

참고문헌 신청
1. [단행본] - Dan Gusfield / 1997 / Algorithms on strings, trees, and sequences: computer science and computational biology / Cambridge University Press google schola 2. [학술지(정기간행물)] - S.F. Altschul / 1989 / Trees, Stars, and Multiple Biological Sequence Alignments / SIAM J. Appl. Math. 49 (1) : 197 ~ 209 google schola 3. [단행본] - M.S. Waterman / 1995 / Introduction to computational biology: Maps, sequences and genomes / CHAPMAN& HALL/CRC google schola 4. [학술대회논문] - X. Zha / 2008 / Highly compressed Aho- Corasick automata for efficient intrusion detection / ISCC 2008 : 298 ~ 303 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - H. Carrillo / 1988 / The multiple sequence alignment problem in biology / SIAM J. Appl. Math 48 (5) : 1073 ~ 1082 google schola

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