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저자정보
홍상균 (한림대학교) 이상진 (한림대학교) 김덕근 (한림대학교) 공진화 (한림대학교) 윤지희 (한림대학교)
저널정보
Korean Institute of Information Scientists and Engineers 한국정보과학회 학술발표논문집 한국정보과학회 2009 가을 학술발표논문집 제36권 제2호(C)
발행연도
2009.11
수록면
107 - 112 (6page)

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최근, 기가시퀀싱(giga-sequencing) 기술의 발달로 비교적 저렴한 비용으로 개인의 유전체 시퀀싱이 가능해지고 있다. 하지만 기가시퀀싱 기술의 빠른 발전 속도에 비해 이들 데이터 처리를 위한 분석 도구의 개발은 매우 미비한 상황이다. 본 논문에서는 기가 시퀀싱 결과로 산출되는 수많은 짧은 DNA 서열조각인 리드를 레퍼런스 서열에 매핑한 결과를 관리, 분석하는 도구, GSDAT를 제안한다. GSDAT는 다양한 매핑결과 포맷을 통합하는 스키마와 이를 데이터베이스화하여 저장, 관리하는 시스템을 제공한다. 또한 매핑결과의 커버리지 분석을 위한 고해상도의 뷰어 기능을 제공하며, 사용자의 요구에 따라 다양한 유전체 데이터베이스와 연동되어 유전자 정보, 리피트 영역, 변이 영역 등과 같은 생물학 정보를 실시간으로 제공한다.

목차

요약
1. 서론
2. 관련 연구
3. GSDAT
4. 결론 및 향후연구
5. 참고문헌

참고문헌 (0)

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