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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술대회자료
- 저자정보
- 저널정보
- Korean Institute of Information Scientists and Engineers 한국정보과학회 학술발표논문집 한국정보과학회 2011한국컴퓨터종합학술대회 논문집 제38권 제1호(B)
- 발행연도
- 2011.6
- 수록면
- 466 - 469 (4page)
이용수
초록· 키워드
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최근에 등장한 Next Generation Sequencing(NGS)은 전통적인 방법에 비해 빠르고 저비용으로 대용량의 시퀀스 데이터를 이용한 차세대 시퀀싱 기술을 말한다. 이렇게 얻은 NGS 데이터를 분석하는 단계 중에서 alignment 단계는 시퀀서에서 얻은 대량의 read를 참조 염기서열에 맵핑하는 단계로 NGS 데이터 분석의 가장 기본이면서 핵심인 단계이다 도구는 긴 참조 염기서열을 색인화해서 짧은 read를 . alignment 빠르게 맵핑하는 용도로 사용된다 현재 많이 사용되고 있는 일반적인 도구들은 입력데이터에 . alignment 대한 별도의 전처리 과정이 없으며 나열된 를 순차적으로 맵핑하는 단순한 구조를 가지고 있다 본 read . 논문은 데이터의 특징 중에 특히 간의 중복성이 존재하고 이를 이용한 의 효율적 공통부분 NGS read read 서열을 찾는다 중복이 가능한 의 공통부분서열과 의 관계를 그래프 이론의 문제로 . read read Hitting Set 모델링하고 여러 가 포함하는 공통 부분서열을 사용해서 단계의 효율을 높일 수 방법을 제 read alignment 안한다.
목차
요약
1. 서론
2. NGS 데이터의 read가 가지는 특징
3. 문제 정의
4. 실험 및 토의
5. 결론
참고문헌
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