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Paenibacillus woosongensis의 유전체 부분 염기서열로부터 유추된 xylanase 유전자를 PCR 증폭하여 대장균에 클로닝하였다. Xylanase 유전자는 211 아미노산으로 구성된 단백질을 코드하며 633 뉴클레오티드로 이루어졌다. 아미노산 잔기배열을 분석한 결과 xylanase는 glycosyl hydrolase family 11에 속하며 Paenibacillus의 xylanase와 85?89% 상동성을 보였다. Xylanase 유전자를 T7 promoter로 과잉발현한 결과 그 발현량이 높지 않았으며, 균체내ㆍ외에서 모두 효소활성이 관찰되었다. 재조합 대장균의 균체파쇄상등액을 사용하여 효소 반응특성을 조사한 결과 pH 5.5와 60℃에서 최대 반응활성을 보였다. 한편 xylanase 의 기질로 xylan과 xylooligosaccharides를 사용하였을 때 xylose 와 xylotriose가 주된 최종 반응산물로 관찰되었으며 xylobiose는 분해하지 못하였으나 이보다 중합도가 큰 xylooligosaccharides는 분해하였다.
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참고문헌
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1. [학술지(정기간행물)] - Bolam, D.N. / 1996 / Mannanase A from Pseudomonas fluorescens spp. cellulosa is a retaining glycosyl hydrolase in which E212 and E320 are the putative catalytic residues / Biochemistry 35 : 16195 ~ 16204
2. [학술지(정기간행물)] - Cuyvers, S. / 2011 / The secondary substrate binding site of the Pseudoalteromonas haloplanktis GH8 xylanase is relevant for activity on insoluble but not soluble substrates / Appl. Microbiol. Biotechnol 92 : 539 ~ 549
3. [학술지(정기간행물)] - Fukuda, M. / 2010 / Cell surface xylanases of the glycoside hydrolase family 10 are essential for xylan utilization by Paenibacillus sp. W-61 as generators of xylo-oligosaccharide inducers for the xylanase genes / J. Bacteriol 192 : 2210 ~ 2219
4. [학술지(정기간행물)] - Gallardo, O. / 2010 / Structural insights into the specificity of Xyn10B from Paenibacillus barcinonensis and its improved stability by forced protein evolution / J. Biol. Chem 285 : 2721 ~ 2733
5. [학술지(정기간행물)] - Gallardo, O. / 2010 / Characterization of a family GH5 xylanase with activity on neutral oligosaccharides and evaluation as a pulp bleaching aid / Appl. Environ. Microbiol 76 : 6290 ~ 6294
2. [학술지(정기간행물)] - Cuyvers, S. / 2011 / The secondary substrate binding site of the Pseudoalteromonas haloplanktis GH8 xylanase is relevant for activity on insoluble but not soluble substrates / Appl. Microbiol. Biotechnol 92 : 539 ~ 549
3. [학술지(정기간행물)] - Fukuda, M. / 2010 / Cell surface xylanases of the glycoside hydrolase family 10 are essential for xylan utilization by Paenibacillus sp. W-61 as generators of xylo-oligosaccharide inducers for the xylanase genes / J. Bacteriol 192 : 2210 ~ 2219
4. [학술지(정기간행물)] - Gallardo, O. / 2010 / Structural insights into the specificity of Xyn10B from Paenibacillus barcinonensis and its improved stability by forced protein evolution / J. Biol. Chem 285 : 2721 ~ 2733
5. [학술지(정기간행물)] - Gallardo, O. / 2010 / Characterization of a family GH5 xylanase with activity on neutral oligosaccharides and evaluation as a pulp bleaching aid / Appl. Environ. Microbiol 76 : 6290 ~ 6294
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