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동굴환경은 표면 토양환경과는 다른 독특한 생태계를 이루는 것으로 알려져 있다. 본 연구를 통하여 제주도 용암동굴(대섭이굴)의 생물막(biofilm)으로부터 얻은 시료를 pyrosequencing 기술을 통해 16S rRNA 유전자를 증폭하여 세균과 고세균의 군집을 조사하였다. 생물막에 우점하는 세균은 Actinobacteria문(phylum)의 Pseudonocardia mongoliensis (전체 세균 reads수의 82.5%)와 깊은 근연관계가 있었으며, 동굴유래의 다양한 세균들과 같이 무리(cluster)를 형성하였다. 동굴 벽면에 빛을 조사 하였을 때 반사되어 빛나는 것은 아마도 방선균의 균사(hypha)들로 이루어진 생물막이 수분을 흡수하지 못하기 때문으로 추정된다. 우점하는 고세균은 Thaumarchaeota문의 I.1a-Associated group (전체 archaeal reads수의 약 66%)에 속한다. 이 고세균 염기서열은 산성 환경(약 pH 5.0)에서 암모니아를 산화하는 고세균으로 알려진 Candidatus Nitrosotalea devanaterra와 높은 근연관계에 있어 동굴환경에서의 질산화에 중요한 기능을 하고 있을 것으로 추정된다. 표층수가 용암토양을 투과하는 과정에서 침출(Leaching)되는 영양분이 대섭이굴 벽면에 다양성이 낮은 독특한 미생물 군집을 형성하는데 기여하고 있는 것으로 추정된다.
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1. [학술지(정기간행물)] - Ara, I. / 2011 / Pseudonocardia mongoliensis sp. nov. and Pseudonocardia khuvsgulensis sp. nov., isolated from soil / Int. J. Syst. Evol. Microbiol 61 : 747 ~ 756
2. [학술지(정기간행물)] - Borsodi, A. K. / 2012 / Biofilm bacterial communities inhabiting the cave walls of the buda thermal karst system, hungary / Geomicrobiol. J 29 : 611 ~ 627
3. [학술지(정기간행물)] - Brochier-Armanet, C. / 2008 / Mesophilic Crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota / Nat. Rev. Microbiol 6 : 245 ~ 252
4. [학술지(정기간행물)] - Cañveras, J. C. / 2001 / Microorganisms and microbially induced fabrics in cave walls / Geomicrobiol. J 18 : 223 ~ 240
5. [학술지(정기간행물)] - Chelius, M.K. / 2004 / Molecular phylogenetic analysis of Archaea and Bacteria in wind cave, South Dakota / Geomicrobiol. J 21 : 123 ~ 134
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3. [학술지(정기간행물)] - Brochier-Armanet, C. / 2008 / Mesophilic Crenarchaeota: proposal for a third archaeal phylum, the Thaumarchaeota / Nat. Rev. Microbiol 6 : 245 ~ 252
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5. [학술지(정기간행물)] - Chelius, M.K. / 2004 / Molecular phylogenetic analysis of Archaea and Bacteria in wind cave, South Dakota / Geomicrobiol. J 21 : 123 ~ 134
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