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학술저널
저자정보
Seong Chan Park (우진 B&G) Ji Hee Lee (순천대학교) Joo Won Kang (순천대학교) Keun Sik Baik (한국기초과학지원연구원) Chi Nam Seong (순천대학교)
저널정보
한국생명과학회 생명과학회지 생명과학회지 제24권 제5호
발행연도
2014.5
수록면
522 - 531 (10page)

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2014

Seasonal Variations in the Bacterial Community of Gwangyang Bay Seawater
Seong Chan Pa ,  k ,  Ji Hee Lee 외 3명 생명과학회지 2014.05 학술저널

2011

Comprehensive Approach of Bacterial Diversity in the Seawater of Gwangyang Bay
Seong Chan Pa ,  k ,  Keun Sik Baik 외 1명 한국미생물학회 학술대회논문집 2011.05 학술대회자료

초록· 키워드

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광양만 해수의 세균 군집의 계절적 변화를 배양법과 비배양법을 사용하여 분석하였다. 200개의 분리 균주에 대해 Amplified rDNA restriction 방법을 적용한 경우 분리 균은 Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes의 4개의 문에 속함을 확인하였다. 비 배양방법으로는 해수로부터 직접 추출한 DNA를 사용하여 pyrosequencing과 변성 농도구배 전기영동(DGGE)을 실시하였다. Pyrosequencing에 의한 16S rRNA 유전자의 염기서열 분석 결과 세균 군집은 춘계와 하계에 각각 24개, 추계에 39개 그리고 동계에 32개의 문으로 구성되었다. 다양도 지수는 추계에 높았으며 춘계에는 우점도 지수가 높았다. Firmicutes 문의 세균이 춘계에 예외적으로 많은 비율을 차지하였으며 나머지 계절에는 Proteobacteria 문의 세균이 우점하였다. 차 우점 분류군은 춘계에는 Proteobacteria 문의 세균인 반면 하계에는 Firmicutes 문, 추계와 동계에는 Bacteroidetes 문의 세균이 차지하였다. 과 수준에서의 우점 분류군은 Bacilliaceae가 춘계에, Rhodobacteraceae와 Bacilliaceae가 하계에, Rhodobacteraceae가 동계에 나타났으나 추계에는 우점 분류군이 없었다. DGGE 에서 확인된 27개의 DNA 절편을 추출하여 계통분석을 실시한 결과 춘계에는 Firmicutes 문에 이어 Proteobacteria 문이 우점하였으며 다른 계절에는 Proteobacteria 문이 우점하였다. 두 가지의 비배양법에 의한 군집 분석 결과 문 수준에서의 세균 군집의 계절적 변화는 유사한 경향이 나타났다.
#Amplified rDNA restriction analysis #bacterial community #denaturing gradient gelelectrophoresis #pyrosequencing

목차

Introduction
Materials and Methods
Results
Discussion
References
초록

참고문헌 (36)

참고문헌 신청
1. [기타자료] - American Public Health Association / 1989 / Standard Methods for the Examination of Water and Wastewater google schola 2. [학술지(정기간행물)] - 백승호 / 2011 / 동계 광양만에서 식물플랑크톤 군집구조의 수평적 분포특성과 성장에 미치는 영양염 제한 특성 / Ocean and Polar Research 33 (2) : 99 ~ 111 google schola 4. [학술지(정기간행물)] - Chao, A / 1984 / Nonparametric-estimation of the number of classes in a population / Scand J Stat 11 : 265 ~ 270 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - Chao, A. / 1992 / Estimating the number of classes via sample coverage / J Am Stat Assoc 87 : 210 ~ 217 google schola 6. [학술지(정기간행물)] - 최창근 / 2008 / 한국 남해안 중부에 위치한 광양만 조간대의 해조상과 군집 / 한국수산과학회지 41 (3) : 201 ~ 207 google schola

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