천연 항균물질의 연구는 대부분 식품소재, 특히 약용식물을 대상으로 하여 많은 연구가 진행되어 왔다. 그러나 식품소재의 경우 대량의 추출물 등을 제조하기 위해 많은 양의 재료가 필요하며, 이로 인한 비용 문제가 발생하게 된다. 미생물은 적절한 환경 하에서 대량 배양이 용이하기 때문에 천연항생제로 이용하기 위해 지속적인 연구가 이루어지고 있다. 본 연구에서는 식물병 억제에 효과가 있는 식물근권미생물을 이용하여 어류질병세균 4종을 대상으로 항균활성을 확인하였다. 이 중 항균활성을 나타낸 균 3종을 선발하여 배양액, 상층액, 균체 현탁액으로 나누어 어느 부위에서 항균효과를 나타내는지 탐색하고, 16S rDNA 염기서열 분석을 통해 균을 동정하였다. 12종의 식물근권세균 중 BRH433-2, THJ609-3, TRH415-2 3종에서 항균활성이 나타나는 것을 확인하였다. 세 균주의 배양액, 상층액, 균체 현탁액 중에서는 균체 현탁액이 가장 강한 항균활성을 나타내는 것을 알 수 있었다. 세 균주의 16S rDNA 염기서열 분석 결과, BRH433-2는 Burkholderia gladioli와 99.5%, B. plantarii 98.9%, B. ubonensis 98.5%, B. pyrrocinia 98.3%, B. glumae 98%로 나타났다. THJ609-3은 Pseudomonas baetica와 97.7%, P. moorei와 P. plecoglossicida에 대해서는 각각 97.6%, 97.5%의 상동성이, TRH415-2는 P. koreensis, P. baetica와 98.4%, P. moraviensis 98.3%의 염기서열 유사도를 나타났다. 따라서 3종의 식물근권세균은 충분한 안정성 및 안전성 실험을 실행한 후, 양식산업에 적용하여 항생제 대체 물질로서의 이용가치가 있다고 생각된다.
Olive flounder (Paralichthys olivaceus) is an important aquaculture fish species in Jeju Island, South Korea. Due to the intensification of flounder fish farming, huge amounts of chemical antibiotics are used against several fish diseases. This has many harmful side effects on fish, as well as human consumers. Hence, an alternative to chemical antibiotic agents is needed for disease control. In this study, three strains of rhizobacteria (BRH433-2, TRH415-2, and THJ609-3) were isolated from the rhizosphere of plants. Assays of their antibacterial activity against fish pathogens, such as S. iniae, S. parauberis, V. anguillarum, and E. tarda, were performed with untreated broth culture (without cell separation), supernatant, and precipitated pellets separated by centrifugation. Among these, the cell suspension prepared from the precipitated pellet showed significant antimicrobial activity when compared with that of the untreated broth culture and centrifugal supernatant. These results indicate that the three isolated rhizobacterial strains exhibit antibacterial activity. Analysis of the 16S rDNA sequences of the BRH-433-2, THJ609-3, and TRH415-2 strains showed the highest similarity to Burkholderia gladioli (99.5%), Pseudomonas baetica (97.7%), and P. koreensis and P. baetica (98.4%), respectively. We suggest that the strains hold promise in disease management of fish.