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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 저널정보
- Korean Institute of Information Scientists and Engineers 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 정보과학회논문지 : 시스템 및 이론 제41권 제4호
- 발행연도
- 2014.8
- 수록면
- 175 - 181 (7page)
이용수
이 논문의 연구 히스토리 (3)
2014
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근사문자열매칭 문제는 컴퓨터보안, 검색엔진, 생물정보학과 같은 다양한 분야에서 연구되고 있다. 근사문자열매칭에서는 불일치 정도를 판단하기 위해, 편집거리나 확장편집거리와 같은 거리함수를 이용한다. 알파벳 ∑의 문자들로 구성된, 길이가 각각 m, n인 두 문자열 X, Y의 편집거리는 X를 Y로 변환하기 위해 필요한 최소 편집연산의 수로 정의된다. 이 때 편집연산은 삽입, 삭제, 교체연산으로 구성된다. X, Y의 확장편집거리는 X를 Y로 변환하기 위해 필요한 최소 확장편집연산의 수로 정의된다. 이때, 확장편집연산은 편집연산에 교환연산을 추가한 연산들로 구성된다. X, Y의 확장편집거리는 동적프로그래밍 기법을 이용하여 O(mn)시간과 공간을 이용하여 계산할 수 있다. 본 논문에서는 X, Y의 확장편집거리를 최대 m개의 쓰레드를 이용하여 O(m+n) 시간과 O(mn) 공간을 이용하여 계산하는 병렬알고리즘을 제시한다. 또한 확장편집거리를 계산하는 순차알고리즘과 병렬알고리즘을 각각 CPU와 GPU 기반으로 구현하여 두 알고리즘의 수행시간을 비교한다. 실험 결과 두 문자열의 길이가 각각 10,000일 때, 병렬알고리즘이 순차알고리즘에 비하여 약 16배 빠른 수행시간을 보였다.
목차
요약
Abstract
1. 서론
2. 관련 연구
3. 확장편집거리 병렬알고리즘과 CUDA 구현
4. 실험 결과 및 분석
5. 결론
References
참고문헌 (10)
참고문헌 신청
1. [학술대회논문] - S. Forrest / 1994 / Self-nonself discrimination in a computer / Research in Security and Privacy, 1994. Proceedings, 1994 IEEE Computer Society Symposium : 202 ~ 212
2. [학술대회논문] - R. Baeza-Yates / 1998 / Fast approximate string matching in a dictionary / String Processing and Information Retrieval: A South American Symposium, 1998. Proceedings : 14 ~ 22
3. [학술지(정기간행물)] - T. F. Smith / 1981 / Identification of Common Molecular Subsequences / Journal of molecular biology 147 (1) : 195 ~ 197
4. [학술지(정기간행물)] - V. I. Levenshtein / 1966 / Binary codes capable of correcting deletions, insertions, and reversals / Soviet physics doklady 10 : 707 ~ 710
5. [학술대회논문] - R. A. Wagner / 1975 / On the complexity of the extended string-to-string correction problem / Proc. of seventh annual ACM symposium on Theory of computing : 218 ~ 223
2. [학술대회논문] - R. Baeza-Yates / 1998 / Fast approximate string matching in a dictionary / String Processing and Information Retrieval: A South American Symposium, 1998. Proceedings : 14 ~ 22
3. [학술지(정기간행물)] - T. F. Smith / 1981 / Identification of Common Molecular Subsequences / Journal of molecular biology 147 (1) : 195 ~ 197
4. [학술지(정기간행물)] - V. I. Levenshtein / 1966 / Binary codes capable of correcting deletions, insertions, and reversals / Soviet physics doklady 10 : 707 ~ 710
5. [학술대회논문] - R. A. Wagner / 1975 / On the complexity of the extended string-to-string correction problem / Proc. of seventh annual ACM symposium on Theory of computing : 218 ~ 223
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