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저자정보
김직수 (한국과학기술정보연구원) 노승우 (한국과학기술정보연구원) 이민호 (상지대학교) 김서영 (한국과학기술정보연구원) 김상완 (한국과학기술정보연구원) 황순욱 (한국과학기술정보연구원)
저널정보
Korean Institute of Information Scientists and Engineers Journal of KIISE Journal of KIISE Vol.42 No.1
발행연도
2015.1
수록면
15 - 22 (8page)

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본 논문에서는 대규모의 계산 작업을 고성능으로 처리해야 하는 신약재창출 시뮬레이션 분야에 분산 슈퍼컴퓨팅 기술을 적용한 사례에 대해 논의하고자 한다. 신약재창출이란 기존에 알려진 약물의 새로운 적응증을 규명하는 것을 의미하며, 이러한 신약재창출은 비교적 짧은 수행시간을 갖는 대규모의 도킹(docking) 연산들을 고성능으로 처리해야한다는 점에서 Many-Task Computing (MTC) 성격을 지니고 있다. 이러한 MTC 응용들의 대표 사례로서 신약재창출 시뮬레이션을 분산 슈퍼컴퓨팅 환경 기반의 HTCaaS 시스템에 적용하였으며, 이를 통해 효율적인 작업 배포, 동적인 자원 할당 및 로드 밸런싱, 안정성 및 다양한 자원들의 효율적인 통합 등이 이러한 과학 응용들을 지원하는 데 있어 필수적인 기능임을 확인할 수 있었다.
#신약재창출 #Many-Task Computing 응용 #분산 슈퍼컴퓨팅 #HTCaaS #drug repositioning #MTC application #distributed supercomputing

목차

요약
Abstract
1. 서론
2. 분산 슈퍼컴퓨팅 기반의 HTCaaS 시스템
3. 관련연구
4. HTCaaS를 활용한 신약재창출 사례 분석
5. 결론 및 향후 계획
References

참고문헌 (20)

참고문헌 신청
M. Lee / 2012 / Large-scale reverse docking profiles and their applications / BMC Bioinformatics 13(17) google schola J. Lee / 2013 / Trends in Computer Aided Drug Discovery, Next Generation / Communications of the Korea Information Science Society 31(8):35~54 google schola Yakup.com google schola I. Raicu / 2008 / Many-Task Computing for Grids and Supercomputers / Proc. of the IEEE/ACM Workshop on Many-Task Computing on Grids and Supercomputers (MTAGS'08) google schola Raicu, Y. / 2007 / Falkon: a Fast and Light-weight tasK executiON framework / Proc. of the 2007 ACM/IEEE conference on Supercomputing (SC’07) google schola

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