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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2013.5
- 수록면
- 95 - 102 (8page)
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생명체 내에서 나타나는 네트워크 중 하나인 대사 경로는 화합물의 상호 관계를 그래프를 통해 표현된다. 대사 경로는 본질적인 복잡성 때문에 대사 경로 내의 흐름을 한 눈에 알 수 있도록 가시화하여 보여 주는 도구가 반드시 필요하다. 이러한 가시화 도구의 경우 노드수가 증가할수록 에지 교차가 기하급수적으로 증가하는 문제가 있다. 따라서 유전체 수준의 대사 경로를 연구하기 위해서는 대사 경로 그래프 레이아웃 상에 나타나는 에지 교차를 줄이는 것이 시각화의 매우 중요한 부분이다. 본 논문은 생물학에서의 대사 경로에 대한 시각화를 위한 2-계층을 이용한 대사 경로 레이아웃 알고리즘을 제안한다. 대사 경로의 구조적 특징을 고려하여 대사 경로 그래프에 존재하는 주요 컴포넌트인 환형 컴포넌트 또는 연결성 높은 노드를 찾아 상위 계층에 레이아웃 하고 나머지 부분그래프는 하위 계층에 레이아웃 한다. 제안한 대사 경로 레이아웃 알고리즘은 유연성 있는 대사 경로 분석의 기초가 된다.
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참고문헌 (17)
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1. [학술대회논문] - Deville, Y. / 2003 / An Overview of Data Models for the Analysis of Biochemical Pathways / Proceedings of International Workshop on Computational Methods in System Biology : 174 ~
2. [인터넷자원] - BioCarta Team / / Biocarta: Charting Pathways of Life
3. [학술지(정기간행물)] - Christian Klukas / 2007 / Dynamic Exploration and Editing of KEGG Pathway Diagrams / Bioinformatics 23 (3) : 344 ~ 350
4. [학술지(정기간행물)] - Demir, E. / 2002 / PATIKA: An Integrated Visual Environment for Collaborative Construction and Analysis of Cellular Pathways / Bioinformatics 18 (7) : 996 ~ 1003
5. [학술지(정기간행물)] - Holford, M. / 2005 / VitaPad: Visualization Tools for the Analysis of Pathway Data / Bioinformatics 21 (8) : 1596 ~ 1602
2. [인터넷자원] - BioCarta Team / / Biocarta: Charting Pathways of Life
3. [학술지(정기간행물)] - Christian Klukas / 2007 / Dynamic Exploration and Editing of KEGG Pathway Diagrams / Bioinformatics 23 (3) : 344 ~ 350
4. [학술지(정기간행물)] - Demir, E. / 2002 / PATIKA: An Integrated Visual Environment for Collaborative Construction and Analysis of Cellular Pathways / Bioinformatics 18 (7) : 996 ~ 1003
5. [학술지(정기간행물)] - Holford, M. / 2005 / VitaPad: Visualization Tools for the Analysis of Pathway Data / Bioinformatics 21 (8) : 1596 ~ 1602
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