Microsatellite 마커를 이용한 옥수수 품종 및 자식 계통에 대한 DNA Fingerprinting 분석

권용삼

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자료유형: 학술저널

저자정보: 권용삼

저널정보: 한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제43권 제3호

발행연도: 2016

수록면: 367 - 375 (9page)

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In the present study, we conducted genetic characterization of 90 commercial maize varieties and parental lines using microsatellite markers. Thirteen microsatellite markers were selected from 100 primer pairs in the maize genome data on the basis of polymorphism information contents (PIC) value and distinct amplification products. These markers detected 5 to 24 alleles, with an average of 13.69. The mean PIC value was 0.865 and ranged from 0.716 to 0.942. The unweighted pair-group method with arithmetical average (UPGMA) analysis was conducted for constructing the dendrogram using Jaccard’s genetic similarity coefficient. The genetic similarity varied from 0.07 to 0.824. Thirteen microsatellite markers identified all 90 maize varieties and parental lines. The maize varieties were clustered into 5 major groups consistent with type and pedigree information. The microsatellite profile database of maize varieties could be used to select comparative varieties through genetic relationship analysis between existing varieties and candidate varieties in distinctness tests.

#DNA profile data base #Genetic diversity #Molecular marker #Simple sequence repeat #Variety identification

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Anderson JA / 1993 / Optimizing parental selection for genetic-linkage maps / Genome 36:181~186

배경미 / 2015 / Development of Genomic SSR Markers and Genetic Diversity Analysis in Cultivated Radish (Raphanus sativus L.) / Horticulture, Environment, and Biotechnology 56(2):216~224

Jung TW / 2006 / SSR markers related to major characteristics affected kernel quality in waxy corn inbred lines / Korean J Crop Sci 51S:185~192

김병완 / 2015 / SSR 분자마커를 이용한 색소 및 비색소옥수수 핵심집단의 유전분석 / 한국육종학회지 47(1):54~62

이주경 / 2012 / SSR 분자마커를 이용한 색소옥수수 계통들에 대한 계통유연관계 및 집단구조 분석 / 한국육종학회지 44(3):301~311

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