Genetic diversity and population structure of Chinese ginseng accessions using SSR markers

안혜진; 정종욱; 박종현; 홍지은; Sebastin Raveendar; 이이; 조익현

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자료유형: 학술저널

저자정보: 안혜진 정종욱 박종현 홍지은 Sebastin Raveendar 이이 조익현

저널정보: 한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제44권 제3호

발행연도: 2017.1

수록면: 312 - 319 (8page)

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The need to preserve and use plant genetic resources is widely recognized, and the prospect of dwindling plant genetic diversity, coupled with increased demands on these resources, has made them a topic of global discussion. In the present study, the genetic diversity and population structure of 73 ginseng accessions collected from six regions in China were analyzed using eight simple sequence repeat (SSR) markers. Major allele frequencies ranged between 0.38 ~ 0.78, with a mean allele frequency value of 0.571. The number of alleles discovered ranged from 3 to 10 per accession, with a mean number of 7; 56 alleles were discovered in total. Gene diversity (GD) and polymorphic information content (PIC) values were similar to each other, and they ranged from 0.36 ~ 0.77 (mean 0.588) and 0.33 ~ 0.74 (mean 0.548), respectively. Accessions were divided into three clusters based on their phylogenetic relationships and genetic similarities, and although the populations were similar, they were not classified according to the region. Regional genetic diversity was also similar, with slight differences observed based on the number of accessions per region. It is expected that the findings of the present study can provide basic data for future studies on ginseng genetic diversity and for breeding ginseng cultivars.

#Panax ginseng #genetic diversity #simple sequence repeats

참고문헌 (36)

참고문헌 신청

서상덕 / 2003 / RAPD 방법을 이용한 국내 수입 인삼(Panax ginseng C. A. meyer)의 다양성 분석 / 한국약용작물학회지 11(5):377~384

Shin HR / 2001 / The cancer-preventive potential of Panax ginseng: a review of human and experimental evidence / Cancer Causes Control 11:565~576

Young-HunShim / 2003 / Molecular Differentiation of Panax Species by RAPD Analysis / Archives of Pharmacal Research 26(8):601~605

Tamura K. / 2007 / MEGA4: molecular evolutionary genetics analysis (MEGA) software version 4.0 / Mol Biol 24:1596~1599

Tatineni V / 1996 / Genetic diversity in elite cotton germplasm determined by morphological characteristics and RAPDs / Crop Sci 361:186~192

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