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논문 기본 정보

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저널정보
한국자료분석학회 Journal of The Korean Data Analysis Society Journal of The Korean Data Analysis Society 제16권 제3호
발행연도
2014.1
수록면
1,241 - 1,248 (8page)

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후생유전학(epigenetics)에서 DNA 메틸화 측정은 암 발생 연구에 매우 중요한 역할을 하고 있으며 여기서 얻어지는 메틸레이션 비율데이터는 암 발생 관련 유전자 탐색의 핵심데이터이다. 왜냐하면 암환자 유전자의 메틸레이션 비율은 정상인과 다르게 나타나며 메틸화 이상이 암의 주요 발생 원인으로 밝혀졌기 때문이다. 본 연구의 목적은 이러한 암 관련 유전자 탐색 방법의 또 다른 접근 방법을 제시하는데 있다. 본 연구에서 사용한 메틸레이션 데이터는 약 92,609개의 유전자에 대한 데이터로서 다음과 같은 분석 절차를 제시하였다. 분석 1단계로 먼저 K-means 군집분석을 실행하여 정상인과 암환자를 구분 짓는 유전자 1390개를 걸러내었다. 그리고 나서 탐색적 분석을 보완하기 위해 다시 통계적 유의성을 지닌 유전자를 Mann-Whitney 검정을 이용하여 최종 암 발생 영향 유전자로 132개를 선택하였다. 마지막 단계로 주성분 로지스틱 회귀분석을 실시하여 영향 크기별 유전자를 발견 할 수 있었다.

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