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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제27권 제3호
발행연도
2017.1
수록면
535 - 541 (7page)

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이 논문의 연구 히스토리 (2)

2017

Deinococcus gammatolerans sp. nov., a Novel Bacterium Isolated from Soil, South Korea
Sathiya ,  aj S ,  inivasan 외 2명 한국미생물학회 학술대회논문집 2017.04 학술대회자료
Deinococcus rubrus sp. nov., a Bacterium Isolated from Antarctic Coastal Sea Water
Sathiya ,  aj S ,  inivasan 외 4명 Journal of Microbiology and Biotechnology 2017.01 학술저널

초록· 키워드

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Two Gram-staining-negative, red-pinkish, coccus-shaped, non-motile, and aerobic bacterial strains, designated Ant21T and Ant22, were isolated from the Antarctic coastal sea water. Strains Ant21T and Ant22 showed UVC and gamma radiation resistance. Phylogenetic analyses based on 16S rRNA gene sequences determined that these strains belong to the genus Deinococcus. Through the analyses of the 16S rRNA gene sequences, strains Ant21T and Ant22 were found to have 97.7% and 97.8% similarity to Deinococcus marmoris DSM 12784T and 97.0% and 97.2% similarity to Deinococcus saxicola AA-1444T, respectively. The sequence similarity with the type strains of other Deinococcus species was less than 96.9% for both strains. Strains Ant21T and Ant22 shared relatively high 16S rRNA gene sequence similarity (99.3%) and had a closely related DNA reassociation value of 84 ± 0.5%. Meanwhile, they showed a low level of DNA-DNA hybridization (<30%) with other closely related species of the genus Deinococcus. The two strains also showed typical chemotaxonomic features for the genus Deinococcus, in terms of the major polar lipid (phosphoglycolipid) and the major fatty acids (C16:0, C16:1 ω6c/ ω7c, iso-C17:0 , and iso-C15:0). They grew at temperatures between 4°C and 30°C and at pH values of 6.0-8.0. Based on the physiological characteristics, the 16S rRNA gene sequence analysis results, and the low DNA-DNA reassociation level with Deionococcus marmoris, strains Ant21T (= KEMB 9004-167T =JCM 31436T) and Ant22 (KEMB 9004-168 =JCM 31437) represent novel species belonging to the genus Deinococcus, for which the name Deinococcus rubrus is proposed.
#Deinococcus #radiation resistance #taxonomy #coastal sea water

목차

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참고문헌 (22)

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Brooks BW / 1981 / Nomenclature for “Micrococcus radiodurans” and other radiation-resistant cocci: Deinococcaceae fam. nov., and Deinococcus gen. nov., including five speci google schola Doetsch RN / 1981 / Manual of Methods for General Bacteriology / American Society for Microbiology : 21 ~ 33 google schola Felsenstein J / 1985 / Confidence limit on phylogenies: an approach using the bootstrap / Evolution 39 : 783 ~ 791 google schola Ferreira AC / 1997 / Deinococcus geothermalis sp. nov., and Deinococcus murrayi sp. nov., two extremely radiationresistant and slightly thermophilic species from hot springs google schola Hall TA. / 1999 / BioEdit: a user-friendly biological sequence alignment editor and analysis program for Windows 95/98/NT / Nucleic Acids Symp. Ser 41 : 95 ~ 98 google schola

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