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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국육종학회 한국육종학회지 한국육종학회지 제49권 제3호
발행연도
2017.1
수록면
119 - 128 (10page)

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이 논문의 연구 히스토리 (7)

2018

NGS 및 HRM 분석을 이용한 8배체 딸기 고밀도 유전자지도 작성
이예린 ,  이준대 한국원예학회 학술발표요지 2018.05 학술대회자료
8배체 딸기의 NGS 기반 고밀도 유전자지도 작성 및 역병균(Phytophthora cactorum)에 의한 crown rot 저항성 QTL 분석
이예린 농학과 2018.01 학위논문
생물검정을 이용한 딸기(Fragaria×ananassa Duch.) 유전자원의역병균(Phytophthora cactorum)에 의한 crown rot 저항성 평가
이예린 ,  장원석 ,  남명현 외 1명 한국육종학회지 2018.01 학술저널

2017

8배체 딸기에서 SNP 분자표지를 이용한 유전자 지도 작성
이예린 ,  정규미 ,  이진훈 외 4명 한국원예학회 학술발표요지 2017.05 학술대회자료
SNP 분자표지를 이용한 8배체 딸기(Fragaria × ananassa Duch.) 유전자지도 작성
이예린 ,  이준대 한국육종학회지 2017.01 학술저널

2016

딸기 품종의 역병(Phytophthora cactorum) 저항성 분석
이예린 ,  정규미 ,  김해인 외 1명 한국원예학회 학술발표요지 2016.05 학술대회자료

2015

Capsicum baccatum 종내 교잡에서 SNP 분자표지를 이용한 유전자 지도 작성
이예린 원예학(원예학) 2015.01 학위논문

초록· 키워드

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An allo-octoploid strawberry (Fragaria × ananassa Duch.) is one of the most important vegetable crops in Korea. However, there were few genomic researches of strawberry due to polyploidy and complexity of its genome. In this study, we aimed to construct a genetic linkage map of strawberry using single nucleotide polymorphism (SNP) markers that were developed through a next-generation sequencing (NGS) analysis. Two strawberry varieties, ‘Sulhyang’ and ‘Senga-sengana’, were used as a maternal and a paternal parent, respectively, and their F1 generation consisting of 94 individuals was used for construction of a genetic linkage map. A total of 19.0 Gbp (‘Sulhyang’) and 21.8 Gbp (‘Senga-sengana’) of genomic sequences were obtained through NGS analysis. Subsequently, approximately 87,000 SNPs were identified and 1,154 primer sets for high-resolution melting (HRM) analysis were designed through bioinformatic analysis. In result, a total of 224 polymorphic HRM markers were developed and 205 markers were mapped on the genetic linkage map of strawberry, which total length was 800.8 cM and the number of linkage groups were 30. This SNP-based genetic linkage map and the 224 SNP markers will be very helpful for the genomic and genetic researches of allo-octoploid strawberry.
#Fragaria × ananassa #HRM #genetic map #NGS #SNP

목차

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참고문헌 (23)

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Bassil NV / 2015 / Development and preliminary evaluation of a 90 K Axiom® SNP array for the allo-octoploid cultivated strawberry Fragaria ×ananassa / BMC Genomics 16 : 155 google schola Cox MP / 2010 / SolexaQA : At-a-glance quality assessment of Illumina second-generation sequencing data / BMC Bioinformatics 11 : 485 ~ google schola Darrow G. / 1966 / The Strawberry ? History, Breeding and Physiology / Holt, Rinehart and Winston google schola Eikemo H / 2015 / Resistance of strawberry genotypes to leather rot and crown rot caused by Phytophthora cactorum / Eur. J. Plant Pathol 143 : 407 ~ 413 google schola Folta KM / 2006 / Strawberry genes and genomics / Cr. Rev. Plant Sci 25 : 399 ~ 415 google schola

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