Microsatellite loci 분석을 통한 한우 지역 브랜드간 유전적 다양성의 비교

이기환; 서강석; 최태정; 윤두학; 양대용; 상병찬

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자료유형: 학술저널

저자정보: 이기환 서강석 최태정 윤두학 양대용 상병찬

저널정보: 한국축산학회(구 한국동물자원과학회) 한국축산학회지 한국축산학회지 제50권 제2호

발행연도: 2008.1

수록면: 167 - 176 (10page)

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Genotype data of eleven microsatellites typed in 713 Hanwoo breed(Korean cattle) animals were used to estimate the genetic diversities and relationship of nine brand populations distributed in six regional areas. Size of microsatellite markers decided using GeneMapper Software(v.4.0) after analyze in kinds of ABI machine of name of 3130 using ABI Stock MarkersTM kit. Frequencies of microsatellites markers were used to estimate heterozygosities, gene diversities and genetic distances. Microsatellite markers showed high polymorphism and 163 alleles were detected from the genotyping of eleven microsatellite markers. Allele frequency results were resemblant to each other in case of most markers and this between each brand where several alleles shared the majority mean. Genetic distances between populations were obtained using Nei’s DA distance method. Expected heterozygosity between each brand population was estimated very analogously. Average expected heterozygosity(0.765) of whole Hanwoo populations had higher diversities than other species of Europe, North American continent and spanish breeds. Genetic distances(0.0413) between ChoneBuk(JS) and ChoneNam(SJ) was nearest than distances between other populations. Genetic distances between KyongGi(AS, YP) and KyongNam(NH) showed far distance than other populations by 0.0493 and 0.0489 each respectively. ChoneNam(SJ) showed near genetic distance relatively with other areas' populations. In the UPGMA tree that is made based on DA distance matrix, some brand populations ramified to area. Because this became evenly genetic because gene flow of Hanwoo was frequent comparatively between each area by stock bull selection of country unit and their sperms(KPN) supply system that is done till today. It can be considered that this effect is by transfer of calf between near geographical areas. Each individuals were not ramified to different group and were spread evenly in phylogenetic dendrogram about all Hanwoo of each brand.

본 연구는 11개 microsatellite marker를 이용하여 국내 6개 지역의 9개 한우 브랜드의 총 713두의 한우(Korean Native Cattle : Hanwoo)에 대한 유전적 다양성과 지역별 유전적 유연관계를 조사하기 위해 실시했다. Marker별 대립유전자의 size는 축산물등급판정소에서 ABI Stock MarkerTM를 사용해서 ABI 3130기종에서 실험한 뒤 GeneMapper Software v.4.0을 이용해 결정하여 분석에 이용하였다. 대립유전자의 빈도는 이형질성, 유전적 다양성과 유전적 거리의 추정에 이용되었다. Microsatellite loci는 높은 다형성을 보였고, 모든 좌위에서 총 163개가 검출되었다. 대부분의 microsatellite marker에서 대립유전자별 출현 빈도 결과가 서로 유사한 값으로 나타났으며 이는 각 브랜드 집단간에 여러 allele을 다수 공유하고 있다는 것을 의미한다. 그리고 각 브랜드 집단간의 기대되는 이형접합율은 매우 비슷하게 추정되었으며 전체 한우집단의 평균 기대 이형접합율은 0.765로 나타나 유럽과 북미대륙, 스페인의 다른 품종들에 비해 상당히 높은 다양성을 보유하고 있었다. 전북지역의 브랜드(JS)와 전남지역의 브랜드(SJ)간의 유전적 거리는 0.0143으로 가장 가까운 것으로 나타났으며, 경기지역(AS, YP)과 경남지역(NH)간의 유전적거리가 각각 0.0493과 0.0489로 다른 집단에 비해 멀리 떨어져 있었다. 그리고 전남지역의 브랜드(SJ) 집단이 다른 지역의 브랜드집단들과 상대적으로 가까운 유전적 거리를 보였다. UPGMA tree에서는 지역별로 브랜드 집단이 분리되는 경향을 보였다. 이는 현재까지 진행되어온 국가 단위 보증종모우의 선발 및 공급 체계에 의해 지역간에 국내 한우 유전자원의 이동이 비교적 활발히 일어나 유전적 균일화가 진행되었기 때문에 기인한 결과라고 할 수 있다. 또한 지리적으로 근접한 지역간에 송아지의 유출입에 의한 영향이 있음이 확인되었다. 각 브랜드의 모든 한우에 대한 개체별 계통지도(phylogenetic dendrogram)에서도 각 개체들이 별개의 특별한 집단으로 분지됨이 없이 고르게 산재되어 섞여있었다.

#Microsatellites #Korean native cattle #Hanwoo) #Genetic diversity #Genetic relationship #Phylogenetic analysis

참고문헌 (27)

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Barker, J. S. F. / 1997 / Genetic variation within and relationships among populations of Asian water buffalo(Bubalus bubalis) / Anim. Genet 28 : 1 ~ 13

Bjornstad, G. / 2003 / Genetic relationship between Mongolian and Norwegian horses / Anim. Genet 34 : 55 ~ 58

Blott, S. C. / 1999 / Discriminating among cattle breeds using genetic markers / Heredity 82 : 613 ~ 619

David botstein / 1980 / Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms / Am J. Hum. Genet 32 : 314 ~ 331

Hanslik S / 2002 / Microsatellite analysis reveals substantial genetic differentiation between contemporary New World and Old World Holstein Friesian popula- tions / Anim. Ge

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