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Ji-Sun Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Se Won Kang (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Kook-Il Han (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Keun Chul Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Mi Kyung Eom (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Min Kuk Suh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Han Sol Kim (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Ju Huck Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung-Hwan Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Jam-Eon Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Byeong Seob Oh (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung Yeob Yu (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seung-Hyeon Choi (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Seoung Woo Ryu (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) Dong Ho Lee (Seoul National University Bundang Hospital) Hyuk Yoon (Seoul National University Bundang Hospital) Byung-Yong Kim (ChunLab) Je Hee Lee (ChunLab) Jung-Sook Lee (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology)
저널정보
한국미생물학회 미생물학회지 미생물학회지 제55권 제3호
발행연도
2019.9
수록면
289 - 292 (4page)

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Lachnospiraceae bacterium KGMB03038 (=KCTC 15821)은 건강한 한국인의 대변 시료로부터 분리된 Lachnospiraceae과, Clostridia 강, Firmicutes 문에 속하는 신속 균주이다. 본 연구에서는 PacBio Sequel 플랫폼을 이용하여 KGMB03038 균주의 유전체를 해독하고 분석하였으며 그 결과, 47.8% G + C 함량을 가진 3,334,474 bp 길이의 완전한 하나의 유전체 컨티그를 얻었다. 이 유전체는 3,099개의 단백질 암호화 유전자와 12개의 rRNA 유전자, 54개의 rRNA 유전자, 그리고 4개의 ncRNA 유전자를 포함하고 있다. 이 유전체 분석 결과, KGMB 03038 균주가 탄수화물의 가수화와 아미노산의 생합성에 관련되어 있는 중요 유전자들을 가지고 있음을 확인하였다.
#Lachnospiraceae #KGMB03038 #carbohydrate #human feces

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참고문헌 (8)

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Bland C / 2007 / CRISPR recognition tool(CRT) : a tool for automatic detection of clustered regularly interspaced palindromic repeats / BMC Biofinformatics 18:209 google schola Chun J / 1995 / A phylogenetic analysis of the genus Nocardia with 16S rRNA gene sequences / Int. J. Syst. Bacteriol 45:240~245 google schola Edgar RC / 2007 / PILER-CR : fast and accurate identification of CRISPR repeats / BMC Bioinformatics 8:18 google schola Hyatt D / 2010 / Prodigal : prokaryotic gene recognition and translation initiation site identification / BMC Biofinformatics 11:119 google schola Lee I / 2017 / ContEst16S : an algorithm that identifies contaminated prokaryotic genomes using 16S RNA gene sequences / Int. J. Syst. Evol. Microbiol 67:2053~2057 google schola

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