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학술저널
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Sohn, Chang-Ho (Department of Chemistry, Seoul National University) Jung, Jin-Woo (Department of Molecular Biotechnology, Institute of Biomedical Science and Technology, Bio/Molecular Informatics Center, Konkuk University) Kang, Gum-Yong (Department of Molecular Biotechnology, Institute of Biomedical Science and Technology, Bio/Molecular Informatics Center, Konkuk University) Kim, Kwang-Pyo (Department of Molecular Biotechnology, Institute of Biomedical Science and Technology, Bio/Molecular Informatics Center, Konkuk University)
저널정보
한국생물정보시스템생물학회 Bioinformatics and Biosystems Bioinformatics and Biosystems 제1권 제2호
발행연도
2006.1
수록면
89 - 94 (6page)

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Mass spectrometry (MS) is widely applied for high throughput proteomics analysis. When large-scale proteome analysis experiments are performed, it generates massive amount of data. To search these proteomics data against protein databases, fully automated database search algorithms, such as Mascot and SEQUEST are routinely employed. At present, it is critical to reduce false positives and false negatives during such analysis. In this review we have focused on aspects of automated protein identification using tandem mass spectrometry (MS/MS) spectra and validation of the protein identifications of two most common automated protein identification algorithms Mascot and SEQUEST.

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