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학술저널
저자정보
Kim, Dae Cheol (Department of Pathology, Dong-A University College of Medicine) Kim, Ki Uk (Departments of Neurosurgery, Dong-A University College of Medicine) Kim, Young Zoon (Division of Neurooncology, Department of Neurosurgery, Samsung Changwon Hospital, Sungkyunkwan University School of Medicine)
저널정보
대한신경외과학회 대한신경외과학회지 대한신경외과학회지 제59권 제1호
발행연도
2016.1
수록면
26 - 36 (11page)

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Objective : This study investigated whether pyrosequencing can be used to determine the methylation status of the MGMT promoter as a clinical biomarker using relatively old archival tissue samples of glioblastoma. We also examined other prognostic factors for survival of glioblastoma patients. Methods : The available study set included formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) tissue from 104 patients at two institutes from 1997 to 2012, all of which were diagnosed histopathologically as glioblastoma. Clinicopathologic data were collected by review of medical records. For pyrosequencing analysis, the PyroMark Q96 CpG MGMT kit (Qiagen, Hilden, Germany) was used to detect the level of methylation at exon 1 positions 17-39 of the MGMT gene, which contains 5 CpGs. Results : Methylation of the MGMT promoter was detected in 43 (41.3%) of 104 samples. The average percentage methylation was $14.0{\pm}16.8%$ overall and $39.0{\pm}14.7%$ for methylated cases. There was no significant pattern of linear increase or decrease according to the age of the FFPE block (p=0.687). In multivariate analysis, age, performance status, extent of surgery, method of adjuvant therapy, and methylation status estimated by pyrosequencing were independently associated with overall survival. Additionally, patients with a high level of methylation survived longer than those with low methylation (p=0.016). Conclusion : In this study, the status and extent of methylation of the MGMT promoter analyzed by pyrosequencing were associated with overall survival in glioblastoma patients. Pyrosequencing is a quantitative method that overcomes the problems of MSP and a simple technique for accurate analysis of DNA sequences.
#MGMT promoter #Methylation #Glioblastoma #Prognosis #Pyrosequencing

목차

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참고문헌 (22)

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Derks S / 2004 / Methylation-specific PCR unraveled / Cell Oncol 26:291~299 google schola Dunn J / 2009 / Extent of MGMT promoter methylation correlates with outcome in glioblastomas given temozolomide and radiotherapy / Br J Cancer 101:124~131 google schola Eng J / 2005 / Receiver operating characteristic analysis : a primer / Acad Radiol 12:909~916 google schola Esteller M / 2000 / Inactivation of the DNA-repair gene MGMT and the clinical response of gliomas to alkylating agents / N Engl J Med 343:1350~1354 google schola Etcheverry A / 2010 / DNA methylation in glioblastoma : impact on gene expression and clinical outcome / BMC Genomics 11:701 google schola

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