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학술저널
저자정보
Khanra, Kalyani (Department of Biotechnology, Haldia Institute of Technology, Regional Research Station) Bhattacharya, Chandan (Bidhan Chandra Krishi Vishyavidyalaya, Regional Research Station) Bhattacharyya, Nandan (Department of Biotechnology, Haldia Institute of Technology, Regional Research Station)
저널정보
아시아태평양암예방학회 Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP Asian Pacific journal of cancer prevention : APJCP 제13권 제5호
발행연도
2012.1
수록면
1,999 - 2,002 (4page)

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Background: DNA polymerase is a single-copy gene that is considered to be part of the DNA repair machinery in mammalian cells. The encoded enzyme is a key to the base excision repair (BER) pathway. It is evident that pol beta has mutations in various cancer samples, but little is known about ovarian cancer. Aim: Identification of any variant form of $pol{\beta}$ cDNA in ovarian carcinoma and determination of association between the polymorphism and ovarian cancer risk in Indian patients. We used 152 samples to isolate and perform RT-PCR and sequencing. Results: A variant of polymerase beta (deletion of exon 4-6 and 11-13, comprising of amino acid 63-123, and 208-304) is detected in heterozygous condition. The product size of this variant is 532 bp while wild type pol beta is 1 kb. Our study of association between the variant and the endometrioid type shows that it is a statistically significant factor for ovarian cancer [OR=31.9 (4.12-246.25) with p<0.001]. The association between variant and stage IV patients further indicated risk (${\chi}^2$ value of 29.7, and OR value 6.77 with 95% CI values 3.3-13.86). The correlation study also confirms the association data (Pearson correlation values for variant/stage IV and variant/endometrioid of 0.44 and 0.39). Conclusion: Individuals from this part of India with this type of variant may be at risk of stage IV, endometrioid type ovarian carcinoma.
#DNA polymerase beta #DNA repair #cDNA #polymorphism #RT-PCR #India

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