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학술저널
저자정보
An, Sung Min (Marine Ecosystem and Biological Research Center, Korea Institute of Ocean Science & Technology) Choi, Dong Han (Marine Ecosystem and Biological Research Center, Korea Institute of Ocean Science & Technology) Lee, Howon (Marine Ecosystem and Biological Research Center, Korea Institute of Ocean Science & Technology) Lee, Jung Ho (Department of Biology Education, Daegu University) Noh, Jae Hoon (Marine Ecosystem and Biological Research Center, Korea Institute of Ocean Science & Technology)
저널정보
한국조류학회(藻類) Algae Algae 제33권 제2호
발행연도
2018.1
수록면
167 - 180 (14page)

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Benthic diatoms are ubiquitous in tidal flats and play major roles in maintaining coastal ecosystems. Spatio-temporal variations in diatom diversity have not been well-studied, mainly because of difficulties in morphological identification and the lack of appropriate genetic tools. To overcome these problems, we used the gene encoding the ribulose bisphosphate carboxylase large-subunit (rbcL) as a molecular marker, and sequenced these genes with the aid of the MiSeq platform. In this manner, we explored the genetic diversity of benthic diatoms in tidal flats of Guenso Bay on the west coast of Korea; differences in the spatial distributions of benthic diatoms were evident. The diatom communities were dominated by Nitzschia, Navicula, and Amphora; their relative distributions were affected by the sand proportion, grain size, and air exposure time. Our results suggest that meta-barcoding of the rbcL gene and next-generation sequencing can be used to explore the diversity of benthic diatoms.
#benthic diatom #diversity #MiSeq #rbcL gene #tidal flat

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Admiraal, W. / 1976 / Influence of light and temperature on the growth rate of estuarine benthic diatoms in culture / Mar. Biol. 39:1~9 google schola Admiraal, W. / 1984 / The ecology of estuarine sediment-inhabiting diatoms / Prog. Phycol. Res. 3:269~322 google schola Amato, A. / 2007 / Reproductive isolation among sympatric cryptic species in marine diatoms / Protist 158:193~207 Crossref An, S. M. / 2017 / Identification of benthic diatoms isolated from the eastern tidal flats of the Yellow Sea: comparison between morphological and molecular approaches / PLoS ONE 12:e0179422 Crossref Baldi, F. / 2011 / Diatom quantification and their distribution with salinity brines in coastal sediments of Terra Nova Bay (Antarctica) / Mar. Environ. Res. 71:304~311 Crossref

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