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학술저널
저자정보
박영상 (서울대학교) 김영준 (서울과학기술대학교) 양태진 (서울대학교) 김지연 (서울과학기술대학교)
저널정보
한국약용작물학회 한국약용작물학회지 한국약용작물학회지 제29권 제6호
발행연도
2021.12
수록면
425 - 433 (9page)
DOI
10.7783/KJMCS.2021.29.6.425

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Background: Rubus coreanus and R. occidentalis are commonly sold as, ‘Bokbunja’, in the Korean market. However, according to Korean Pharmacopoeia, ‘Bokbunja’ refers to the unripened fruits of R. coreanus. Therefore, authentication of R. coreanus and its related species is necessary to prevent adulteration and improper use.
Methods and Results: Genomic DNA was extracted from leaves, stem and fruits of R. coreanus, fruits of R. occidentalis and leaves of R. longisepalus and R. hirsutus. The anthocyanin profile of R. coreanus and R. occidentalis was identified by high performance liquid chromatography/diode-array detection. We designed four universal barcoding primer sets with optimal restriction enzyme sites to identify polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphisms (PCRRFLPs) between R. coreanus, the newly assembled chloroplast genome of R. occidentalis, and two related species. In addition, two Insertion or Deletion (InDel) markers were also developed. These markers were successfully used to distinguish each species in nine samples.
Conclusions: In this study, we sequenced and assembled the complete chloroplast genome of R. occidentalis and developed a DNA barcoding method to differentiate it from other related species. Thus, anthocyanin profiling, PCR-RFLPs, and InDel markers are useful authentication tools to distinguish R. coreanus from R. occidentalis.
#Rubus coreanus #Chloroplast #Insertion or Deletion Marker #PCR-RFLP #Single Nucleotide Polymorphism

목차

ABSTRACT
서언
재료 및 방법
결과 및 고찰
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참고문헌 (28)

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Carver T / 2012 / Artemis : An integrated platform for visualization and analysis of high-throughput sequence-based experimental data / Bioinformatics 28:464~469 google schola Greiner S / 2019 / OrganellarGenome DRAW(OGDRAW)version 1. 3. 1 : Expanded toolkit for the graphical visualization of organellar genomes / Nucleic Acids Research 47:59~64 google schola Greiner S / 2015 / Why are most organelle genomes transmitted maternally? / Bioassays 37:80~94 google schola 정희정 / 2021 / 오미자과 식물 종 판별을 위한 엽록체 기반 InDel 마커의 개발 / 한국약용작물학회지 29(1):11~16 dbpia Kang SJ / 2018 / The complete chloroplast genome sequence of Korean Lonicera japonica and intraspecies diversity / Mitochondrial DNA Part B 3:941~942 google schola

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