메뉴 건너뛰기
.. 내서재 .. 알림
소속 기관/학교 인증
인증하면 논문, 학술자료 등을  무료로 열람할 수 있어요.
한국대학교, 누리자동차, 시립도서관 등 나의 기관을 확인해보세요
(국내 대학 90% 이상 구독 중)
로그인 회원가입 고객센터 ENG
주제분류
인문학
인문학 일반 역사학 철학 종교학 어문학 기타 인문학
사회과학
사회과학 일반 경영학 관광학 교육학 군사학 문헌정보학 법학 사회학 신문방송학 심리과학 정치외교학 지리학 행정학 경제학 무역학 인류학 기타 사회과학
자연과학
자연과학 일반 물리학 생물학 생활과학 수학·통계학 천문학 지구과학 화학 기타 자연과학
공학
공학 일반 건축공학 기계공학 산업공학 재료·에너지공학 전기전자공학 조선해양공학 화학공학 컴퓨터학 기타공학
의약학
의학 일반 간호학 수의학 약학 한의학 기초의학 임상의학 기타 의약학
농수해양학
농수해양학 일반 농학 수산학 식품과학 임학 축산학 해상운송학 기타 농수해양학
예술체육학
예술 일반 디자인 미술 미용 사진 음악학 의상 체육 공연매체예술 기타 예술체육학
복합학
학제간연구 과학기술학 뇌인지과학 기술정책 기타 복합학

ENG

추천
검색

논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
김정선 (국립농업과학원 농업생명자원부 유전체과) 구윤숙 (국립농업과학원 농업생명자원부 유전체과) 박신기 (테라젠이텍스 연구소 생물정보학팀) 김세희 (국립원예특작과학원 원예작물부 과수과) 박현우 (국립농업과학원 농업생명자원부 유전체과) 원소윤 (국립농업과학원 농업생명자원부 유전체과)
저널정보
한국육종학회 한국육종학회지 한국육종학회지 제53권 제4호
발행연도
2021.12
수록면
350 - 360 (11page)
DOI
10.9787/KJBS.2021.53.4.350

이용수

표지
📌
연구주제
📖
연구배경
🔬
연구방법
🏆
연구결과
AI에게 요청하기
추천
검색

초록· 키워드

오류제보하기
Prunus persica “Mihong” cultivar is a domesticated white peach that was generated from the crossing between “Yumyeong” and“Chiyomaru” cultivars in the Republic of Korea in 1995. We launched “Mihong” genome sequencing in 2018 and “Mihong” reached to 200scaffold and 241 Mb sequences using long-read sequencing and Hi-C technology. F1 populations of ”Kawanakajima Hakuto,” “Mihong,”“Changhowon Hwangdo,” and “Yumi” were developed in NIHHS. These four cultivars were sequenced and assembled using the SOAPdenovoversion 2.04. First, we surveyed the SSRs in “Mihong” assembly sequences and extracted the ±300 bp flanking sequences containing SSRs. Second, the assembly sequences of three cultivars were aligned and mapped against “Mihong” ±300 bp flanking sequences using BLASTn(version 2.2.29+). We anticipated the differential length in SSRs among the four cultivars. We sorted the primers with a standard deviationover 4.5 (STEV > 4.5) among the four cultivars. In addition, we surveyed the primers having difference in over 10 bp with “KawanakajimaHakuto” and “Mihong” for polymorphic markers in the mapping population. All primer pairs were designed to generate amplicons of 150-200bp in coating SSR regions using primer3 (version 3-2.2.3). We selected 260 SSR markers with a physical distance of average per 1 Mb. These SSR markers accounted for 74% polymorphism in the four genotypes. Finally, a F1 population of “Kawanakajima Hakuto” and “Mihong”covered 884.5 cM with 465 SNPs and 86 SSRs and this genetic map matched correctly to the HI-C pseudomolecule of P. persica.
#peach #Prunus persica #SSR markers #genetic map

목차

등록된 정보가 없습니다.

참고문헌 (25)

참고문헌 신청
Bernacchi D / 1998 / Advanced backcross QTL analysis in tomato, 1. Identification of QTLs for traits of agronomic importance from Lycopersicon hisutum / Theor Appl Genet 97:381~397 google schola Cantarella C / 2015 / PSR : Polymorphic SSR retrieval / BMC research notes 8:525 google schola Chagné D / 2014 / The draft genome sequence of European pear(Pyrus communis L. ‘Bartlett’) / PLOS ONE 9:e92644 google schola Chen H / 2015 / Construction of a high-density simple sequence repeat consensus genetic map for pear (Pyrus spp.) / Plant Mol Bio Rep 33:316~325 google schola 조강희 / 2015 / 복숭아 유전체 및 전사체 최근 연구 동향 / Journal of Plant Biotechnology 42(4):312~325 Crossref

함께 읽어보면 좋을 논문

논문 유사도에 따라 DBpia 가 추천하는 논문입니다. 함께 보면 좋을 연관 논문을 확인해보세요!

이 논문의 저자 정보

최근 본 자료

전체보기

댓글(0)

0