메뉴 건너뛰기
.. 내서재 .. 알림
소속 기관/학교 인증
인증하면 논문, 학술자료 등을  무료로 열람할 수 있어요.
한국대학교, 누리자동차, 시립도서관 등 나의 기관을 확인해보세요
(국내 대학 90% 이상 구독 중)
로그인 회원가입 고객센터 ENG
주제분류
인문학
인문학 일반 역사학 철학 종교학 어문학 기타 인문학
사회과학
사회과학 일반 경영학 관광학 교육학 군사학 문헌정보학 법학 사회학 신문방송학 심리과학 정치외교학 지리학 행정학 경제학 무역학 인류학 기타 사회과학
자연과학
자연과학 일반 물리학 생물학 생활과학 수학·통계학 천문학 지구과학 화학 기타 자연과학
공학
공학 일반 건축공학 기계공학 산업공학 재료·에너지공학 전기전자공학 조선해양공학 화학공학 컴퓨터학 기타공학
의약학
의학 일반 간호학 수의학 약학 한의학 기초의학 임상의학 기타 의약학
농수해양학
농수해양학 일반 농학 수산학 식품과학 임학 축산학 해상운송학 기타 농수해양학
예술체육학
예술 일반 디자인 미술 미용 사진 음악학 의상 체육 공연매체예술 기타 예술체육학
복합학
학제간연구 과학기술학 뇌인지과학 기술정책 기타 복합학

ENG

추천
검색

논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
최정우 (University of Guelph) 이성진 (강원대학교) Xiaoping Liao (University of Alberta) 박새롬 (강원대학교) 전현정 (농업진흥청) 정원홍 (한국생명공학연구원) Paul Stothard (University of Alberta) Yeon Soo Park (Gangwon Provincial Livestock Research Center Heongseong Korea) 이정구 (강원대학교) 이경태 (농촌진흥청) 김상환 (Hankyong National University) 오재돈 (한경대학교) 김남신 (한국생명공학연구원) Tae-Hun Kim (Rural Development Administration) Hak Kyo Lee (Hankyong National University)
저널정보
한국분자세포생물학회 Molecules and Cells Molecules and Cells 제36권 제3호
발행연도
2013.9
수록면
203 - 211 (9page)
DOI
10.1007/s10059-013-2347-0

이용수

표지
📌
연구주제
📖
연구배경
🔬
연구방법
🏆
연구결과
AI에게 요청하기
추천
검색

초록· 키워드

오류제보하기
Since the completion of the bovine sequencing projects, a substantial number of genetic variations such as single nucleotide polymorphisms have become available across the cattle genome. Recently, cataloguing such genetic variations has been accelerated using massively parallel sequencing technology. However, most of the recent studies have been concentrated on European Bos taurus cattle breeds, resulting in a severe lack of knowledge for valuable native cattle genetic resources worldwide. Here, we present the first whole-genome sequencing results for an endangered Korean native cattle breed, Chikso, using the Illumina HiSeq 2,000 sequencing platform. The genome of a Chikso bull was sequenced to approximately 25.3-fold coverage with 98.8% of the bovine reference genome sequence (UMD 3.1) covered. In total, 5,874,026 single nucleotide polymorphisms and 551,363 insertion/deletions were identified across all 29 autosomes and the X-chromosome, of which 45% and 75% were previously unknown, respectively. Most of the variations (92.7% of single nucleotide polymorphisms and 92.9% of insertion/deletions) were located in intergenic and intron regions. A total of 16,273 single nucleotide polymorphisms causing missense mutations were detected in 7,111 genes throughout the genome, which could potentially contribute to variation in economically important traits in Chikso. This study provides a valuable resource for further investigations of the genetic mechanisms underlying traits of interest in cattle, and for the development of improved genomics-based breeding tools.
#Chikso #InDel #massively parallel sequencing #SNP

목차

등록된 정보가 없습니다.

참고문헌 (28)

참고문헌 신청
Abecasis, G.R / 2012 / An integrated map of genetic variation from 1,092 human genomes / Nature 491:56~65 google schola Elsik, C.G / 2009 / The genome sequence of taurine cattle: a window to ruminant biology and evolution / Science 324:522~528 google schola Bovine HapMap Consortium / 2009 / Genome-wide survey of SNP variation uncovers the genetic structure of cattle breeds / Science 324:528~532 google schola Choi, T.J. / 2009 / Establishment of phylogenomic characteristics for Korean traditional cattle breeds google schola Hailu Dadi / 2012 / Effect of Population Reduction on mtDNA Diversity and Demographic History of Korean Cattle Populations / ASIAN-AUSTRALASIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCES 25(9):1223~1228 Crossref

이 논문의 저자 정보

최근 본 자료

전체보기

댓글(0)

0