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저자정보
조익현 (국립원예특작과학원) 방경환 (농촌진흥청 작물과학원) 홍지은 (농촌진흥청 국립원예특작과학원) 김장욱 (농촌진흥청) 이정우 (국립원예특작과학원) 김동휘 (농촌진흥청 작물과학원) 현동윤 (농촌진흥청 작물과학원) 류호진 (충북대학교) 김영창 (농촌진흥청 작물과학원)
저널정보
한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제43권 제4호
발행연도
2016.12
수록면
417 - 421 (5page)

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The complete chloroplast genome sequence of Panax ginseng breeding line ‘G07006’, showing higher salt tolerance, was confirmed by de novo assembly using whole genome next-generation sequences. The complete chloroplast (CP) genome size is 156,356?bp, including two inverted repeats (IRs) of 52,060?bp, separated by the large single-copy (LSC 86,174?bp) and the small single-copy (SSC 18,122?bp) regions. One hundred fourteen genes were annotated, including 80 protein-coding genes, 30 tRNA genes, and 4 rRNA genes. Among them, 18 sites were duplicated in the inverted repeat regions. By comparative analyses of the previously identified CP genome sequences of nine cultivars of P. ginseng and that of G07006, five useful SNPs were defined in this study. Since three of the five SNPs were cultivar-specific to Chunpoong and Sunhyang, they could be easily used for distinguishing from other ginseng accessions. However, on arranging SNPs according to their gene location, the G07006 genotype was ‘GTGGA’, which was distinct from other accessions. This complete chloroplast DNA sequence could be conducive to discrimination of the line G07006 (salt- tolerant) and further enhancement of the genetic improvement program for this important medicinal plant.
#Panax ginseng #Complete chloroplast genome #Single nucleotide polymorphism

목차

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참고문헌 (18)

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방경환 / 2015 / Internal Transcribed Spacer Barcoding DNA Region Coupled with High Resolution Melting Analysis for Authentication of Panax Species / 한국약용작물학회지 23(6):439~445 Crossref Jin-Woong Cho / 2004 / Photosynthetic Response of Korean Ginseng under Saline Condition / 한국작물학회지 49(3):100~104 google schola Jansen RK / 2005 / Methods for obtaining and analyzing chloroplast genome sequences / Methods in Enzymology 395:348~384 google schola 진현오 / 2009 / 인삼재배지의 영양환경이 인삼의 생육에 미치는 영향 / Journal of Ginseng Research 33(3):234~239 dbpia 조익현 / 2014 / 고려인삼 신품종 ‘천량’ 특이적 DNA 판별 마커 개발 / 한국약용작물학회지 22(6):429~434 dbpia

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