PANM Database Version 6.0: An Updated and Expanded Resource for Efficient Annotation of Arthropoda, Nematoda, and Mollusca Genes

박소영; 정준양; 홍찬의; 신현준; 이혁; 이경원; 상민규; 박지은; 송대권; 황희주; 강세원; 박홍석; 한연수; 이용석

doi:https://doi.org/10.9710/kjm.2024.40.2.87

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자료유형: 학술저널

저자정보: 박소영 정준양 홍찬의 신현준 이혁 이경원 상민규 박지은 송대권 황희주 강세원 박홍석 한연수 이용석

저널정보: 한국패류학회 한국패류학회지 한국패류학회지 제40권 제2호

발행연도: 2024.1

수록면: 87 - 90 (4page)

DOI: https://doi.org/10.9710/kjm.2024.40.2.87

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The updated PANM database version 6.0 includes approximately 1.3 times more amino acid sequences compared to its previous version. Although it contains only about 3.6% of the sequences compared to the commonly used NCBI-nr database for annotation, PANM 6.0 was specifically constructed using amino acid sequences of genes from Arthropoda, Nematoda, and Mollusca. This allows for reduced annotation time and improved accuracy for genes, genomes, or transcriptome sequences of species belonging to these three phyla. Like previous versions, PANM database version 6 (http://panm.sch.ac.kr/) freely accessible to all researchers and is expected to be useful for researchers studying invertebrates in the future.

#PANM-DB #NGS analysis #invertebrate

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