Evaluating the ability of some natural phenolic acids to target the main protease and AAK1 in SARS COV-2

Heba I. Ghamry; Amany Belal; Mohamed K. El‐Ashrey; Haytham O. Tawfik; Reem I. Alsantali; Ahmad J. Obaidullah; Ahmed A. El‐Mansi; Doaa Abdelrahman

doi:10.1038/s41598-023-34189-6

학술저널 cc-by Full-text

저자정보: Heba I. Ghamry Amany Belal Mohamed K. El‐Ashrey Haytham O. Tawfik Reem I. Alsantali Ahmad J. Obaidullah Ahmed A. El‐Mansi Doaa Abdelrahman

출처: Springer Science and Business Media LLC Scientific Reports 13(1)

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Researchers are constantly searching for drugs to combat the coronavirus pandemic caused by SARS-CoV-2, which has lasted for over two years. Natural compounds such as phenolic acids are being tested against Mpro and AAK1, which are key players in the SARS-CoV-2 life cycle. This research work aims to study the ability of a panel of natural phenolic acids to inhibit the virus's multiplication directly through Mpro and indirectly by affecting the adaptor-associated protein kinase-1 (AAK1). Pharmacophore mapping, molecular docking, and dynamic studies were conducted over 50 ns and 100 ns on a panel of 39 natural phenolic acids. Rosmarinic acid (16) on the Mpro receptor (- 16.33 kcal/mol) and tannic acid (17) on the AAK1 receptor (- 17.15 kcal/mol) exhibited the best docking energy against both receptors. These favourable docking score values were found to be superior to those of the co-crystallized ligands. Preclinical and clinical research is required before using them simultaneously to halt the COVID-19 life cycle in a synergistic manner.

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