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Springer Science and Business Media LLC BMC Bioinformatics 24(1)
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    We propose a memory-efficient representation of the pan-genome graph that supports subgraph visualization and lossless approximate pattern matching of reads against the graph using search schemes. The C++ source code of our software, called Nexus, is available at https://github.com/biointec/nexus under AGPL-3.0 license.
    #De Bruijn graph #DNA microarray #Computational biology #De Bruijn sequence #Index (typography) #Genome #Biology #Graph #Computer science #Genetics #Gene #Mathematics #World Wide Web #Theoretical computer science #Gene expression #Combinatorics

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