Spatial host-microbiome profiling demonstrates bacterial-associated host transcriptional alterations in pediatric ileal Crohn’s disease

Sooyoung Jang; Eun Joo Lee; Sowon Park; Hye Ji Lim; Byoung-Ki Ahn; H. Yoon; Hong Koh; Yu Rang Park

doi:10.1186/s40168-025-02178-8

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저자정보: Sooyoung Jang Eun Joo Lee Sowon Park Hye Ji Lim Byoung-Ki Ahn H. Yoon Hong Koh Yu Rang Park

출처: Springer Science and Business Media LLC Microbiome 13(1)

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Our spatial host-microbiome profiling approach enables simultaneous species-level identification of bacteria and host transcriptomics. It reveals the intricate interactions between host cells and bacteria, providing cellular-level insights into CD pathogenesis. Our approach offers a powerful tool for investigating host-microbiome interactions in various microbiome-associated diseases to direct new strategies for microbiome-based therapeutics and prognostic markers. Video Abstract.

#Biology #Microbiome #Host (biology) #Medical microbiology #Crohn's disease #Microbial ecology #Disease #Host factors #Microbiology #Immunology #Bacteria #Genetics #Pathology #Medicine

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