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주제분류

논문 기본 정보

자료유형
학위논문
저자정보

(숭실대학교, 숭실대학교 대학원)

지도교수
조광휘
발행연도
저작권
숭실대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.

이용수22

표지

초록· 키워드

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화합물의 고유 성질은 구조의 특성에 따른다. 때문에 화합물의 구조와 성질 간 관계를 파악하는 것은 매우 중요한데, 이 관계를 정량적으로 표현하는 것이 QSAR(Quantitative Structure Activity Relationships)란 방법론이다. 하지만 현재 QSAR 방법론을 수행 하는 데는 많은 문제가 있다. QSAR modeling 과정은 descriptor selection, model building, model validation 등 여러 단계로 이루어지는데, 각각 단계들은 다른 software를 사용하여 작업 공간의 통일이 이루어지지 않는다. 또한 5천여 개의 descriptor에서 4개만을 선택하여 최적의 조합을 찾는다고 가정할 때 5,000C4개의 경우의 수이므로 최적의 해를 찾는 것은 매우 많은 시간과 반복이 요구되는 작업이다. 이에 따라 하나의 작업 공간에서 모든 QSAR modeling 작업을 할 수 있고, 많은 경우의 수 중에 최적의 descriptor를 짧은 시간 내에 선택해 줄 수 있는 platform이 존재한다면 QSAR를 이용해 신 물질을 개발하는데 획기적 전기를 마련할 것이다. PyQSAR는 modeling 전 과정을 진행할 수 있는 기능을 갖추고 있어서 사용자는 작업 공간의 이동 없이 PyQSAR라는 단일 platform 안에서 QSAR modeling 의 전 과정을 진행할 수 있다. QSAR model을 만들기 위해 greedy search algorithm 등 다양한 feature selection algorithm이 사용되지만, PyQSAR는 clustering 기법과 genetic algorithm를 함께 이용하는 방법을 통해 더욱 빠르고 정확도가 높은 model을 만들 수 있도록 한다. 실제로 clustering과 genetic algorithm의 조합으로 만들어진 PyQSAR를 이용하여 1시간 안에 도출한 model의 정확도를 측정한 결과가 기존의 논문의 결과보다 더 높거나 같았다.

목차

  1. 국문초록 ⅳ
    영문초록 ⅵ
    제 1 장 INTRODUCTION 1
    제 2 장 METHODS 3
    2.1 Development Details 3
    2.2 Work Flow 7
    2.3 Artificial Intelligence Algorithm for QSAR Modeling 11
    2.3.1 Descriptor Clustering 13
    2.3.2 Genetic Algorithm 17
    제 3 장 RESULTS & DISCUSSION 20
    제 4 장 CONCLUSION 26
    참고문헌 28
    부 록 32

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