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(대구대학교, 대구대학교 대학원)

지도교수
이창우
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대구대학교 논문은 저작권에 의해 보호받습니다.

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티오레독신(Trx)는 잘 보존된 산화환원 단백질로 Trx-접힘 구조를 가진다. 이 연구의 목적은 Trx의온도적응에 있어서 방향족 아미노산 짝의 영향을 밝히는 것이며, 연구대상으로 호냉성 세균인Sphingomonas sp.의 Trx (SpTrx)와 상온 세균인 대장균의 Trx (EcTrx)를 이용한다. SpTrx는 α-나선 1과α-나선 3 사이에 크기가 큰 Trp11-Phe69 짝을 가지지만, EcTrx는 크기가 작은 Phe12-Tyr70 짝을가지고 있다. SpTrx의 방향족 아미노산을 크기가 작은 Phe-Tyr 또는 Phe-Phe로 치환하면 단백질의녹는점과 요소에 의한 단백질 풀림이 감소하고, 구조유연성이 증가한다. 이들 SpTrx 변이체에서 Ala65잔기를 Thr로 치환하면 Phe-Tyr 짝보다 Phe-Phe 짝을 가진 변이체의 구조가 더 불안정해진다. 제작한SpTrx 변이체는 모두 인슐린 환원능력이 야생형보다 감소하였다. 반대로 EcTrx에서는 크기가 큰 Trp잔기가 존재할 때 구조가 불안정해졌으며, Trp-Tyr 짝 보다는 Trp-Phe 짝을 가진 변이체가 더 영향을받았다. 반면에 EcTrx에서 Asp-Thr 사이의 수소결합과 Phe-Tyr 짝은 구조 밀도를 증가시켜서 콤팩트한구조형성에 기여하였다. 이 결과는 상온 Trx에서 Thr을 Ala로 치환시키면(EcTrx에서 Thr66 잔기) α-나선 3이 불안정지고 이로 인해 SpTrx에서와 같이 호냉성 Trx에서 크기가 큰 방향족 아미노산이 α-나선1과 α-나선 3 사이에 위치하여 구조 밀도가 감소함을 의미한다. SpTrx와 EcTrx 모두에서 방향족아미노산 짝과 이에 인접한 Thr 잔기는 서로 간에 영향을 주었다. 본 연구의 결과는 Trx의 온도적응이해에 기여하며 Trx 단백질이 다양한 온도 조건에서 최적 효소활성을 나타낼 수 있음을 제시한다.

목차

  1. I. Introduction 1
    II. Materials and methods 3
    1. Materials. 3
    2. Structural analysis and multiple sequence alignment. 3
    3. Site-directed mutagenesis. 4
    4. Expression and purification of SpTrx WT and mutant proteins. 4
    5. Fluorescence spectroscopy. 5
    6. Protein thermal shift analysis. 6
    7. Far-UV Circular dichroism (CD) spectroscopy. 6
    8. Insulin reduction assay using SpTrx WT and mutants. 7
    III. Results 8
    1. Expression and purification of recombinant SpTrx wild-type (WT) and mutants. 8
    2. Thermal stability of SpTrx WT and mutants. 8
    3. Chemical stability of SpTrx WT and mutants. 9
    4. Conformational flexibility of SpTrx WT and mutants. 10
    5. Changes in the secondary and tertiary structures of SpTrx WT and mutants. 10
    6. Insulin reduction activity. 11
    7. Effect of counterpart mutations on the thermal stability in EcTrx. 11
    IV. Discussion 13
    References 34
    Abstract 41

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