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한국원예학회 HORTICULTURE ENVIRONMENT and BIOTECHNOLOGY HORTICULTURE ENVIRONMENT and BIOTECHNOLOGY Vol.49 No.5
발행연도
2008.10
수록면
325 - 331 (7page)

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PCR performance of different primer sets that are used for detecting Acidovorax avenae subsp. citrulli from bacterial fruit blotch (BFB)-infected plant tissue and seeds in watermelon were evaluated. PCR specificity and sensitivity in detecting Acidovorax avenae subsp. citrulli were examined for four BFB-PCR primer sets. From screening of 10 different bacterial species and three subspecies of Acidovorax avenae, the best PCR-specificity to A. avenae subsp. citrulli was observed from RST 49/51 after digestion of the PCR products with Sau 96I. PCR sensitivity was evaluated by using serial dilutions of template DNA samples achieved from BFB-infected watermelon seeds and leaf tissues, and the highest detection sensitivity was observed from Seminis WFB 1/2. To improve PCR specificity to A. avenae subsp. citrulli of Seminis WFB 1/2, PCR amplicons from five bacterial species were sequenced and a new CAPS marker was developed based on the restriction enzyme site polymorphisms unique to A. avenae subsp. citrulli. CAPS marker uses primer sequence of Seminis WFB 1/2 of high detection sensitivity, and discriminates A. avenae subsp. citrulli from any other bacterial species.
#IMS-PCR #seed grow-out test #seed wash-PCR #PCR-RFLP

목차

Abstract
Introduction
Materials and Methods
Results
Discussion
Acknowledgements
Literature Cited

참고문헌 (18)

참고문헌 신청
1. [학술지(정기간행물)] - Cheng, A.H. / 2000 / Susceptibility of cucurbits to Acidovorax avenae subsp. citrulli and control of fruit blotch on melon / Plant Pathol. Bull 9 : 151 ~ 156 google schola 2. [학술지(정기간행물)] - Hopkins, D.L. / 2002 / Seed transmission of Acidovorax avenae subsp. citrulli in cucurbits / Hortscience 37 : 924 ~ 926 google schola 3. [학술지(정기간행물)] - Isakeit, T. / 1997 / First report of infection of honeydew with Acidovorax avenae subsp / citrulli. Plant Dis 81 : 694 ~ 701 google schola 4. [학술지(정기간행물)] - Langstin, D.B / 1999 / First report of a fruit rot of pumpkin caused by Acidovorax avenae subsp. citrulli. in Georgia / Plant Dis 83 : 100 ~ 107 google schola 5. [학술지(정기간행물)] - Latin, R.X. / 1990 / Bacterial fruit blotch of watermelon in Indiana / Plant Dis 74 : 331 ~ 335 google schola

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