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논문 기본 정보

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학술저널
저자정보
Youhyeon Hwang (Gachon University) Min Oh (Gachon University) Youngmi Yoon (Gachon University)
저널정보
한국컴퓨터정보학회 한국컴퓨터정보학회논문지 한국컴퓨터정보학회 논문지 제21권 제1호
발행연도
2016.1
수록면
115 - 123 (9page)

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In this study, we collect various side effect pairs which are appeared frequently at many drugs, and select side effect pairs that have higher severity. For every selected side effect pair, we extract common genetic networks which are shared by side effects’ genes and drugs’ target genes based on PPI(Protein-Protein Interaction) network. For this work, firstly, we gather drug related data, side effect data and PPI data. Secondly, for extracting common genetic network, we find shortest paths between drug target genes and side effect genes based on PPI network, and integrate these shortest paths. Thirdly, we develop a classification model which uses this common genetic network as a classifier. We calculate similarity score between the common genetic network and genetic network of a drug for classifying the drug. Lastly, we validate our classification model by means of AUC(Area Under the Curve) value.
#Drug #Side effect #Genetic network #Bioinformatics #Data mining #PPI #Classification model

목차

Abstract
I. Introduction
II. Preliminaries
III. The Proposed Scheme
IV. Results
V. Conclusions
REFERENCE

참고문헌 (15)

참고문헌 신청
Classen D C, Pestotnik S L, Evans R S, Lloyd J F, Burke J P. “Adverse drug events in hospitalized patients. Excess length of stay, extra costs, and attributable mortality.”, JAMA, Vol. 277, No. 4, pp. 301–6, Jan. 1997. google schola Song mi Lee, “Drug leads to disease”, Sodam publisher, Oct. 2007. google schola Kuhn, Michael, et al. "A side effect resource to capture phenotypic effects of drugs.", Molecular systems biology, Vol. 6, No. 1, pp. 343, Jan. 2010. google schola Perucca, Piero, and Frank G. Gilliam. "Adverse effects of antiepileptic drugs.", The Lancet Neurology, Vol. 11, No. 9, pp. 792-802, Sep. 2012. google schola Atias, Nir, and Roded Sharan. "An algorithmic framework for predicting side effects of drugs.", Journal of Computational Biology, Vol. 18, No. 3, pp. 207-218, March 2011. google schola

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