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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
저널정보
한국식물생명공학회 Journal of Plant Biotechnology Journal of Plant Biotechnology 제43권 제2호
발행연도
2016.1
수록면
213 - 222 (10page)

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This study aims to establish a system for the rapid discrimination of Zoysia species using metabolite fingerprinting of FT-IR spectroscopy combined with multivariate analysis. Whole cell extracts from leaves of 19 identified Zoysia japonica, 6 identified Zoysia sinica, and 38 different unidentified Zoysia species were subjected to Fourier transform infrared spectroscopy (FT-IR). PCA (principle component analysis) and PLS-DA (partial least square discriminant analysis) from FT-IR spectral data successfully divided the 25 identified turf grasses into two groups, representing good agreement with species identification using molecular markers. PC (principal component) loading values show that the 1,100 ~ 950 cm -1 region of the FT-IR spectra are important for the discrimination of Zoysia species. A dendrogram based on hierarchical clustering analysis (HCA) from the PCA and PLS-DA data of turf grasses showed that turf grass samples were divided into Zoysia japonica and Zoysia sinica in a species-dependent manner. PCA and PLS-DA from FT-IR spectral data of Zoysia species identified and unidentified by molecular markers successfully divided the 49 turf grasses into Z. japonica and Z. sinica. In particular, PLS-DA and the HCA dendrogram could mostly discriminate the 47 Z. japonica grasses into two groups depending on their origins (mountainous areas and island area). Considering these results, we suggest that FT-IR fingerprinting combined with multivariate analysis could be applied to discriminate between Zoysia species as well as their geographical origins of various Zoysia species.
#Partial least square discriminant analysis #PLS-DA) 서 론 #Turf grasses #Zoysia japonica #Zoysia sinica #Fourier transform - infrared spectroscopy #FT-IR) #Principal component analysis #PCA)

목차

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참고문헌 (26)

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안명숙 / 2015 / 한약자원 품목별 표준시료와 기내 생산 부정근의 FT-IR 스펙트럼 기반 대사체동등성 신속 비교 / Journal of Plant Biotechnology 42(3):257~264 dbpia Christians N / 1998 / Fundamentals of turfgrass management / Ann Arbor Press google schola Chung SJ / 2013 / SCAR markers were developed to identify zoysiagrass mutants exhibiting fine leaf characteristics / CNU J Agr Sci 40:1~5 google schola D’Souza L / 2008 / Use of Fourier Transform Infrared (FTIR) Spectroscopy to Study Cadmium-Induced Changes in PadinaTetrastromatica (Hauck) / Anal Chem Insights 3:135~143 google schola Dumas P / 2003 / The use of synchrotron infrared microspectroscopy in biological and biomedical investigations / Vib Spectrosc 32:3~21 google schola

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