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저널정보
한국미생물생명공학회 Journal of Microbiology and Biotechnology Journal of Microbiology and Biotechnology 제15권 제3호
발행연도
2005.1
수록면
656 - 659 (4page)

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Small peptides synthesized by nonribosomalpeptide synthetases (NRPSs) genes are found in bacteria andfungi. While some microbial taxa have few, others make alarge number and variety. However, biochemical characterizationof the products synthesized by NPRS demands a great deal ofefforts. Since the completion of genome projects of numerousmicroorganisms, the numbers of available NRPSs genes arebeing expanded. Prediction of the peptides encoded by NRPScould save time and efforts. We chose the NRPS gene fromBradyrhizobium japonicum as a model to predict the peptidestructure encoded by NRPS genes. Using computationalanalyses, the domain structure of this gene was defined, andthe structure of a peptide synthesized by this NRPS wasdeduced. It was found that it encoded a tripeptide consistingof proline-serine-phenylalanine. This method would be helpfulto predict the structure of small peptides with various NPRSgenes from the genome sequence.
#Nonribosomal peptide synthetase #domain analysis #Bradyrhizobium japonicum

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A / 1995 / A putative new peptidesynthase operon in Bacillus subtilis 141 (ni) : 645 ~ 141 648 google schola A / 1997 / Modular peptide synthetase involved in nonribosomal peptidesynthesis 97 : 2651 ~ 2673 google schola Becker / 2004 / Molecularbasis for imine macrocyclization 325 : 35 ~ 42 google schola Challis / 2000 / a new peptidesiderophore encoded by the Streptomyces coelicolorgenome Structure prediction from the sequence of its nonrisobosomalpeptide synthetase : 111 ~ google schola Challis / 2000 / structure-based model of amino acid recognitionby nonribosomal peptide synthetase adenylation domains 7 : 211 ~ 224 google schola

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