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인체 유래의 세균 군집 분석은 범죄 현장에서 개인식별을 위한 정보 제공, 생물 테러 사건의 수사, 사후 경과 시간(PMI)을 추정하는 등 법미생물학적 응용에 있어 큰 잠재력을 가진다. 그러나 인간 유골에서의 세균 군집에 대한 연구는 미흡하다. 따라서 본 연구에서는 차세대 염기서열 분석법을 이용하여 변사자 유골의 세균 군집을 분석하였으며, 발견된 장소와 각각의 시료에서 세균 구성 차이와 법미생물학적 활용 가능성을 살펴보고자 하였다. 총 94점의 골편을 사용하였으며 발견된 장소에 따라 해양(13점), 실내(34점), 야외(47점)로 나누어 살펴보았다. 세 그룹의 결과를 통합적으로 보았을 때, 공통적으로 Clostridium, Peptoniphilus, Sporanaerobactor 등의 속이 발견되었다. 반면, 해양 그룹에서 Steroidobacter, Azospirillum, Photobacterium, Vibrio, 실내 그룹에서 Ignatzschineria Tepidanaerobacter, Virgibacillus, Lactobacillus, 그리고 야외 그룹에서는 Thermodesulfovibrio, Cohnella, Sphaerisporangium, Aeromicrobium 등이 특이적으로 발견되었다. 환경그룹에 따라 특이적인 속이 발견되었으며, 개별 시료에서 또한 서로 다른 세균 구성을 보였다. 주좌표분석(PCoA)을 이용한 세균 군집 분석 결과는, 대부분 시료가 발견 환경에 따라 그룹화(clustering)되는 경향을 보였다. 따라서 변사자 유골 세균 군집 분석기법의 법미생물학적 활용이 가능할 것으로 사료된다.
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재료 및 방법
결과 및 고찰
적요
References
참고문헌 (23)
참고문헌 신청
Blaser MJ. 2010. Harnessing the power of the human microbiome. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107, 6125?6126.
Brown K, Church D, Lynch T, and Gregson D. 2014. Bloodstream infections due to Peptoniphilus spp.: Report of 15 cases. Clin. Microbiol. Infect. 20, O857?O860.
Cho Y, Lee MH, Kim HS, Park M, Kim MH, Kwon H, Kim JB, Lee YH, and Lee DS. 2019. Comparative analysis of Sanger and next generation sequencing methods for 16S rDNA analysis of post-mortem specimens. Aust. J. Forensic Sci. 51, 426?445.
Costello, EK, Lauber CL, Hamady M, Fierer N, Gordon JI, and Knight R. 2009. Bacterial community variation in human body habitats across space and time. Science 326, 1694?1697.
Faith JJ, Guruge JL, Charbonneau M, Subramanian S, Seedorf H, Goodman AL, Clemente JC, Knight R, Heath AC, Leibel RL, et al. 2013. The long-term stability of the human gut microbiota. Science 341, 1237439.
Brown K, Church D, Lynch T, and Gregson D. 2014. Bloodstream infections due to Peptoniphilus spp.: Report of 15 cases. Clin. Microbiol. Infect. 20, O857?O860.
Cho Y, Lee MH, Kim HS, Park M, Kim MH, Kwon H, Kim JB, Lee YH, and Lee DS. 2019. Comparative analysis of Sanger and next generation sequencing methods for 16S rDNA analysis of post-mortem specimens. Aust. J. Forensic Sci. 51, 426?445.
Costello, EK, Lauber CL, Hamady M, Fierer N, Gordon JI, and Knight R. 2009. Bacterial community variation in human body habitats across space and time. Science 326, 1694?1697.
Faith JJ, Guruge JL, Charbonneau M, Subramanian S, Seedorf H, Goodman AL, Clemente JC, Knight R, Heath AC, Leibel RL, et al. 2013. The long-term stability of the human gut microbiota. Science 341, 1237439.
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