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학술저널
저자정보
Kim, Jin-Wook (School of Computer Science and Engineering, Seoul National University) Roh, Kang-Ho (School of Computer Science and Engineering, Seoul National University) Park, Kun-Soo (School of Computer Science and Engineering, Seoul National University) Park, Hyun-Seok (Macrogen) Seo, Jeong-Sun (Macrogen)
저널정보
한국생물정보시스템생물학회 Bioinformatics and Biosystems Bioinformatics and Biosystems 제1권 제1호
발행연도
2006.1
수록면
61 - 66 (6page)

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We propose a new fragment assembly program MLP (mate-based layout with PHRAP). MLP consists of PHRAP, repeat masking, and a new layout algorithm that uses the mate pair information. Our experimental results show that by using MLP instead of PHRAP, we can significantly reduce the difference between the assembled sequence and the original genome sequence.

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