Functional Haplotype Frequencies of the Interleukin-1B Promoter in the Korean Population

Lee, Kyung-A

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자료유형: 학술저널

저자정보: Lee, Kyung-A (Department of Laboratory Medicine, Yonsei University College of Medicine)

저널정보: 한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제6권 제1호

발행연도: 2008.1

수록면: 29 - 31 (3page)

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Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the promoter region of the IL-1B (interleukin-1) gene have been implicated in a variety of diseases that have an inflammatory component. However, there has been significant heterogeneity among study results, especially between Caucasian and Asian populations. Recently, it has been reported that SNPs in the IL-1B gene affect transcription, according to haplotype context, and genetic association studies may be more informative if functional SNP haplotypes of population are analyzed. Therefore, we estimated the distribution of IL-1B promoter haplotypes in 433 Koreans using the three major functional IL-1B promoter SNPs (IL-1B -1464, -511, and -31) and compared the results with those in Caucasians. The difference in IL-1B promoter haplotype frequency between Korean and Caucasian populations was statistically significant. The potentially more inflammatory haplotypes had higher frequencies in Koreans when compared with Caucasians. These Korean haplotype data will be useful for future association studies between IL-1B SNPs and disease risk.

#Interleukin-1B #polymorphism #haplotype #Korean

참고문헌 (19)

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Iacoviello, L. / 2005 / Polymorphisms of the interleukin-1beta gene affect the risk of myocardial infarction and ischemic stroke at young age and the response of mononuclear cells to stimulation in vitro / Arterioscler Thromb Vasc Biol 25:222~227

Camargo, M. C. / 2006 / Interleukin- 1beta and interleukin-1 receptor antagonist gene polymorphisms and gastric cancer: a meta-analysis / Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 15:1674~1678

Griffin, W. S. / 2000 / The pervasiveness of interleukin-1 in alzheimer pathogenesis: a role for specific polymorphisms in disease risk / Exp Gerontol 35:481~487

Kornman, K. S. / 1997 / The interleukin-1 genotype as a severity factor in adult periodontal disease / J Clin Periodontol 24:72~77

Francis, S. E. / 1999 / Interleukin-1 receptor antagonist gene polymorphism and coronary artery disease / Circulation 99:861~866

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