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학술저널
저자정보
Shin, Donghyun (Department of Agricultural Biotechnology, Animal Biotechnology Major, and Research Institute for Agriculture and Life Sciences, Seoul National University) Park, Kyoung-Do (Genomic Informatics Center, Hankyong National University) Ka, Sojoeng (Department of Agricultural Biotechnology, Animal Biotechnology Major, and Research Institute for Agriculture and Life Sciences, Seoul National University) Kim, Heebal (Department of Agricultural Biotechnology, Animal Biotechnology Major, and Research Institute for Agriculture and Life Sciences, Seoul National University) Cho, Kwang-hyeon (Division of Animal Breeding and Genetics, National Institute of Animal Science, Rural Development Administration)
저널정보
한국유전체학회 Genomics & informatics Genomics & informatics 제13권 제4호
발행연도
2015.1
수록면
146 - 151 (6page)

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Previous studies in Holstein have shown 35% to 51.8% heritability in milk production traits, such as milk yield, fat, and protein, using pedigree data. Other studies in complex human traits could be captured by common single-nucleotide polymorphisms (SNPs), and their genetic variations, attributed to chromosomes, are in proportion to their length. Using genome-wide estimation and partitioning approaches, we analyzed three quantitative Holstein traits relevant to milk production in Korean Holstein data harvested from 462 individuals genotyped for 54,609 SNPs. For all three traits (milk yield, fat, and protein), we estimated a nominally significant (p = 0.1) proportion of variance explained by all SNPs on the Illumina BovineSNP50 Beadchip ($h^2_G$). These common SNPs explained approximately most of the narrow-sense heritability. Longer genomic regions tended to provide more phenotypic variation information, with a correlation of 0.46~0.53 between the estimate of variance explained by individual chromosomes and their physical length. These results suggested that polygenicity was ubiquitous for Holstein milk production traits. These results will expand our knowledge on recent animal breeding, such as genomic selection in Holstein.
#breeding #genomic selection #Holstein #heritability #single-nucleotide polymorphism

목차

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참고문헌 (13)

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Jiang L. / 2010 / Genome wide association studies for milk production traits in Chinese Holstein population / PLoS One 5:e13661 google schola Fontanesi L. / 2014 / A candidate gene association study for nine economically important traits in Italian Holstein cattle / Anim Genet 45:576~580 google schola Meredith BK. / 2012 / Genome-wide associations for milk production and somatic cell score in Holstein-Friesian cattle in Ireland / BMC Genet 13:21 google schola Goddard ME. / 2009 / Mapping genes for complex traits in domestic animals and their use in breeding programmes / Nat Rev Genet 10:381~391 google schola Maher B / 2008 / Personal genomes : the case of the missing heritability / Nature 456:18~21 google schola

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